More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0706 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  77.02 
 
 		 749 aa  1194    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  100 
 
 		 776 aa  1560    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  58.77 
 
 		 808 aa  910    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  76.11 
 
 		 749 aa  1182    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  76.5 
 
 		 751 aa  1179    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  39.34 
 
 		 769 aa  538  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  35.23 
 
 		 749 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.52 
 
 		 756 aa  498  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  33.09 
 
 		 829 aa  464  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  32.8 
 
 		 820 aa  463  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  32.49 
 
 		 833 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  33.71 
 
 		 745 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  36.27 
 
 		 750 aa  437  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  30.49 
 
 		 851 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  34.5 
 
 		 763 aa  431  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  33.8 
 
 		 754 aa  429  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  32.49 
 
 		 751 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  37 
 
 		 938 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  35.45 
 
 		 836 aa  324  3e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.52 
 
 		 502 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  27.32 
 
 		 971 aa  207  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  30.75 
 
 		 1565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  27.73 
 
 		 941 aa  193  9e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  29.55 
 
 		 551 aa  193  9e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  30.06 
 
 		 1528 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  35.92 
 
 		 228 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  36.13 
 
 		 233 aa  114  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  35.21 
 
 		 216 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  37.91 
 
 		 212 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  32.69 
 
 		 217 aa  107  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  37.36 
 
 		 212 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  37.36 
 
 		 212 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  37.02 
 
 		 212 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  33.64 
 
 		 212 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  31.65 
 
 		 230 aa  94.4  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  30.56 
 
 		 234 aa  92.8  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  25 
 
 		 555 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  36.54 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  29.3 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  33.14 
 
 		 214 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  29.95 
 
 		 343 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  24.25 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  25.64 
 
 		 554 aa  71.2  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  32.39 
 
 		 219 aa  70.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  25.2 
 
 		 1013 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  33.52 
 
 		 215 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  28.57 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  23.66 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  23.66 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  23.66 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  23.66 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  23.66 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  23.66 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  23.16 
 
 		 560 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  23.92 
 
 		 560 aa  67  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  30.59 
 
 		 221 aa  67.4  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  23.16 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  22.8 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  23.71 
 
 		 560 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  28.4 
 
 		 666 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  32.03 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  27.22 
 
 		 649 aa  61.2  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03359  ATP-dependent RNA helicase  31.71 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191775  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  29.55 
 
 		 216 aa  60.1  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  26.71 
 
 		 158 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.57 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  31.94 
 
 		 905 aa  59.3  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  25.97 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  31.67 
 
 		 160 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  31.67 
 
 		 160 aa  59.3  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  25.77 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.15 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  23.53 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3115  inducible ATP-independent RNA helicase  31.54 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28472  ATP-dependent RNA helicase  31.97 
 
 		 836 aa  58.5  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0501  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.43 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0890  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.59 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724766 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  32.14 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.99 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01750  ATP-dependent RNA helicase mak5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCI0]  26.29 
 
 		 770 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  22.29 
 
 		 937 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  33.04 
 
 		 635 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2814  predicted protein  30.67 
 
 		 396 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00413083  normal  0.0212716 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1295  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.58 
 
 		 441 aa  57  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  33.04 
 
 		 639 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 453 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.102362  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10380  Dicer-like protein 2 [Includes Endoribonuclease dcl2(EC 3.1.26.-);ATP-dependent helicase dcl2(EC 3.6.1.-)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C5H7]  30.61 
 
 		 1269 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917081  normal  0.453481 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4097  ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.89 
 
 		 417 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.872576  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0290  nuclease  50.98 
 
 		 51 aa  56.6  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  30.81 
 
 		 1046 aa  56.6  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.09 
 
 		 571 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.05 
 
 		 854 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4727  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.85 
 
 		 460 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  27.07 
 
 		 220 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.75 
 
 		 741 aa  55.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.27 
 
 		 1062 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3809  DEAD/DEAH box helicase-like  27.22 
 
 		 649 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.130283  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  29.27 
 
 		 812 aa  55.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  26.36 
 
 		 1069 aa  56.2  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.23 
 
 		 537 aa  55.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>