More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2643 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2643  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
533 aa  1085    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.93 
 
 
464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.536242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.17 
 
 
521 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14040  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.31 
 
 
507 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  0.0213445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0902  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.94 
 
 
483 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.169794  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3565  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.23 
 
 
482 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1295  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.54 
 
 
480 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.43 
 
 
529 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4430  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.54 
 
 
480 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4554  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.67 
 
 
489 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0971  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.4 
 
 
492 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.951762  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1623  DEAD/DEAH box helicase-like protein  54.04 
 
 
424 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.216615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1070  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.29 
 
 
483 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1253  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.65 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1776  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.69 
 
 
423 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0620  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.22 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.651173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2119  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.32 
 
 
452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637401  hitchhiker  0.000114297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0770  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.47 
 
 
383 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000481841  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0943  putative ATP-dependent RNA helicase  51.19 
 
 
396 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1474  DEAD/DEAH box helicase-like  51.19 
 
 
384 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.738757  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2278  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.69 
 
 
452 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.64228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0522  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.57 
 
 
443 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00923533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.94 
 
 
475 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000426275  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3035  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.06 
 
 
438 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000379043  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2070  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.88 
 
 
438 aa  355  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514873  normal  0.181762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2779  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.96 
 
 
482 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000517174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.96 
 
 
490 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0356  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.65 
 
 
432 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0945  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.96 
 
 
451 aa  352  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4109  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.99 
 
 
435 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297113  hitchhiker  0.000114369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0407  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.6 
 
 
439 aa  350  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3876  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.48 
 
 
438 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.587664  hitchhiker  0.000145647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0411  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.86 
 
 
439 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3614  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.86 
 
 
439 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0461  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.3 
 
 
434 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.388345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3432  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.08 
 
 
439 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3928  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.48 
 
 
438 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0514  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.75 
 
 
441 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0317755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0410  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.86 
 
 
439 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3215  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.65 
 
 
439 aa  348  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3951  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.44 
 
 
438 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4069  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.44 
 
 
438 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.341266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0339  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.58 
 
 
435 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.181774  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0449  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.7 
 
 
432 aa  347  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0202  ATP-dependent RNA helicase RhlB  44.5 
 
 
428 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0735  DEAD helicase family protein  43.83 
 
 
433 aa  342  7e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2582  DEAD/DEAH box helicase-like  46.3 
 
 
431 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4013  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.1 
 
 
430 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0158  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.71 
 
 
428 aa  339  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0146  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.58 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00149472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4005  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.77 
 
 
421 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00596063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4303  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.54 
 
 
421 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0431153  normal  0.722207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0155  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.24 
 
 
428 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.54 
 
 
421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.54 
 
 
421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0399  ATP-dependent RNA helicase RhlB  41.9 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4126  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.54 
 
 
421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4195  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.54 
 
 
421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4144  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.68 
 
 
421 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4205  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.1 
 
 
430 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03658  ATP-dependent RNA helicase  43.68 
 
 
421 aa  335  9e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000314324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.68 
 
 
421 aa  335  9e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00222167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4223  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.68 
 
 
421 aa  335  9e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0291518  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.68 
 
 
421 aa  335  9e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0178  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.58 
 
 
428 aa  335  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4036  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.58 
 
 
428 aa  335  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.269062  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03607  hypothetical protein  43.68 
 
 
421 aa  335  9e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000127308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3996  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.68 
 
 
421 aa  335  9e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0509  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.58 
 
 
423 aa  335  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5213  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.68 
 
 
421 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.68 
 
 
421 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.55 
 
 
440 aa  333  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3191  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.48 
 
 
418 aa  332  9e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00568  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.04 
 
 
429 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00338  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.45 
 
 
437 aa  330  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002096  ATP-dependent RNA helicase RhlB  41.59 
 
 
439 aa  329  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.12 
 
 
428 aa  329  9e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.41 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2697  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.55 
 
 
438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03716  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.53 
 
 
574 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.08 
 
 
419 aa  323  6e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4221  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.32 
 
 
421 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989994  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3674  ATP-dependent RNA helicase RhlB  40.68 
 
 
574 aa  315  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.72 
 
 
521 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  44.12 
 
 
510 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.2 
 
 
491 aa  309  8e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.82 
 
 
515 aa  309  8e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.82 
 
 
515 aa  309  8e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2245  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.12 
 
 
544 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.298458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  42.6 
 
 
506 aa  306  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2156  ATP-dependent RNA helicase RhlB  41.6 
 
 
544 aa  306  6e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.97 
 
 
439 aa  305  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.59 
 
 
438 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  42.04 
 
 
492 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.3 
 
 
505 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  42.99 
 
 
472 aa  302  9e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.45 
 
 
571 aa  302  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.97 
 
 
504 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.99 
 
 
486 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.86 
 
 
463 aa  301  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>