41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1024 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  35.27 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  31.55 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  30.88 
 
 		 749 aa  89  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  29.86 
 
 		 938 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  32.7 
 
 		 820 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  33.18 
 
 		 851 aa  86.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  34.6 
 
 		 833 aa  85.5  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  32.56 
 
 		 749 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  27.4 
 
 		 769 aa  85.1  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  33.18 
 
 		 829 aa  85.1  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  29.8 
 
 		 763 aa  84.3  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  32.31 
 
 		 751 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  30.14 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  31.43 
 
 		 808 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  29.44 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  29.44 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  31.63 
 
 		 749 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  29.03 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  29.91 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  33.72 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  27.75 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  26.15 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  28.5 
 
 		 751 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  28.28 
 
 		 754 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  29.74 
 
 		 745 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  33 
 
 		 836 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  27.91 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.1 
 
 		 756 aa  72.8  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  30.93 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  30.94 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  29.65 
 
 		 750 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  28.57 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  28.57 
 
 		 776 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  29.94 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  24.07 
 
 		 343 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  24.12 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0291  ERCC4  28.48 
 
 		 170 aa  52  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  27.81 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  21.72 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  23.31 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>