More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1208 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  100 
 
 		 938 aa  1915    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  69.6 
 
 		 769 aa  753    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  52.04 
 
 		 749 aa  558  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  45.7 
 
 		 820 aa  511  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  46.17 
 
 		 829 aa  511  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.52 
 
 		 756 aa  498  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  45.93 
 
 		 851 aa  485  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  49.41 
 
 		 754 aa  481  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  43.78 
 
 		 836 aa  478  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  48.14 
 
 		 745 aa  478  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  48.52 
 
 		 750 aa  476  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  47.45 
 
 		 751 aa  475  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  43.7 
 
 		 833 aa  463  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  45.92 
 
 		 763 aa  463  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  36.27 
 
 		 808 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  41.14 
 
 		 749 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  39.07 
 
 		 776 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  40.55 
 
 		 749 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  40.16 
 
 		 751 aa  364  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.49 
 
 		 502 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  30.53 
 
 		 971 aa  243  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  30.25 
 
 		 551 aa  234  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  30.62 
 
 		 1565 aa  221  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 1528 aa  207  7e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  28.43 
 
 		 941 aa  200  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  37.21 
 
 		 233 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  37.2 
 
 		 217 aa  128  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  34.72 
 
 		 216 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  34.56 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  36.22 
 
 		 230 aa  111  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  37.57 
 
 		 211 aa  108  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 212 aa  108  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  33.49 
 
 		 219 aa  106  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  37.91 
 
 		 212 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  37.91 
 
 		 212 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  37.36 
 
 		 212 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  32.29 
 
 		 228 aa  103  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  35.51 
 
 		 214 aa  103  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  31.8 
 
 		 215 aa  100  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  32.6 
 
 		 234 aa  98.6  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  37.22 
 
 		 212 aa  96.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  29.86 
 
 		 215 aa  87.4  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  30.52 
 
 		 216 aa  85.5  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  31.65 
 
 		 221 aa  83.2  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  24.42 
 
 		 440 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  40.96 
 
 		 564 aa  68.9  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42450  predicted protein  31.51 
 
 		 975 aa  67.8  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.488375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94867  predicted protein  30.26 
 
 		 575 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0308188  normal  0.0300986 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  37.61 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  25.2 
 
 		 343 aa  64.3  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.44 
 
 		 538 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  41.56 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.3 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.3 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.3 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.3 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08713  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  30.43 
 
 		 985 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06640  Pre-mRNA splicing factor RNA helicase PRP28, putative  32.5 
 
 		 738 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.847821  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01820  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 		 1099 aa  60.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15057  predicted protein  40.78 
 
 		 654 aa  60.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.72 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27821  predicted protein  46.38 
 
 		 822 aa  61.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.72 
 
 		 556 aa  60.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  41.58 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  39.73 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  31.01 
 
 		 666 aa  59.7  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.78 
 
 		 591 aa  59.3  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30908  excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4  28.89 
 
 		 975 aa  58.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.07 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0291  ERCC4  34.95 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  43.75 
 
 		 580 aa  57.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  26.89 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119572  Ddx49-related DEAD box helicase superfamily II protein  33.33 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.708695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.03 
 
 		 545 aa  57.4  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004056  ATP-dependent RNA helicase  33.33 
 
 		 402 aa  57.4  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.668799  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_1794  predicted protein  44.87 
 
 		 421 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00327182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.96 
 
 		 643 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0362  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30 
 
 		 562 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0486542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3711  putative ATP-dependent RNA helicase  35.71 
 
 		 436 aa  57.4  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24549  predicted protein  33.59 
 
 		 346 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2926  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.08 
 
 		 468 aa  57.4  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10557  ATP-dependent RNA helicase ded1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C2M6]  40.79 
 
 		 668 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.645505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.14 
 
 		 819 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.96 
 
 		 618 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00590  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 		 605 aa  57  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.51 
 
 		 952 aa  56.6  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02850  ATP-dependent RNA helicase, putative  42.47 
 
 		 484 aa  57  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0341  DEAD/DEAH box helicase-like  46.48 
 
 		 529 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0103074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5247  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 		 481 aa  57  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5639  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.86 
 
 		 481 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0860387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1618  DEAD/DEAH box helicase-like  30.23 
 
 		 447 aa  56.6  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.14 
 
 		 819 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.89 
 
 		 403 aa  57  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.3 
 
 		 433 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.3 
 
 		 433 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.48 
 
 		 589 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  30.67 
 
 		 398 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3701  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.37 
 
 		 707 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5577  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.86 
 
 		 481 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5592  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.24 
 
 		 481 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.99386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>