More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119572 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119572  Ddx49-related DEAD box helicase superfamily II protein  100 
 
 
417 aa  860    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.708695  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02850  ATP-dependent RNA helicase, putative  43.8 
 
 
484 aa  324  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40593  Dead-Box Protein 8, ATP-dependent helicase involved in rRNA processing  44.03 
 
 
445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  41.85 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01540  conserved hypothetical protein  36.12 
 
 
619 aa  296  3e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04903  ATP-dependent RNA helicase dbp8 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B3H7]  39.47 
 
 
525 aa  296  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  39.39 
 
 
466 aa  292  8e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28984  predicted protein  40.31 
 
 
433 aa  290  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  40.86 
 
 
396 aa  278  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.96 
 
 
403 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.34 
 
 
466 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9893  predicted protein  38.84 
 
 
455 aa  259  5.0000000000000005e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.37 
 
 
590 aa  259  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.59 
 
 
466 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.8 
 
 
511 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.63 
 
 
463 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.64 
 
 
545 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.08 
 
 
550 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3358  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.74 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00456117  normal  0.742173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.44 
 
 
493 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.74 
 
 
538 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  38.52 
 
 
529 aa  253  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.67 
 
 
494 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.52 
 
 
525 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.52 
 
 
528 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  38.52 
 
 
528 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  38.52 
 
 
533 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  38.52 
 
 
525 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.52 
 
 
528 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.7 
 
 
467 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  38.52 
 
 
528 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.44 
 
 
493 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.14 
 
 
454 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  38.52 
 
 
528 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.3 
 
 
511 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1767  DEAD/DEAH box helicase-like  38.48 
 
 
540 aa  251  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.3 
 
 
497 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  39.14 
 
 
454 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.14 
 
 
454 aa  250  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.73 
 
 
491 aa  250  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.14 
 
 
454 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.96 
 
 
489 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.03 
 
 
509 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1950  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.5 
 
 
522 aa  250  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.14 
 
 
455 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.14 
 
 
454 aa  250  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  39.14 
 
 
454 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  37.06 
 
 
614 aa  249  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.84 
 
 
506 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.14 
 
 
454 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.34 
 
 
515 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.69 
 
 
583 aa  249  6e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.78 
 
 
423 aa  249  6e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.93 
 
 
513 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.34 
 
 
525 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 
482 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.34 
 
 
525 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.34 
 
 
526 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.87 
 
 
454 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.96 
 
 
504 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2658  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.02 
 
 
399 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.919133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.65 
 
 
537 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  38.95 
 
 
460 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.11 
 
 
514 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 
580 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1158  ATP-dependent RNA helicase  40.21 
 
 
447 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.54 
 
 
482 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  37.74 
 
 
580 aa  247  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.92 
 
 
607 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000502308  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  37.14 
 
 
491 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.54 
 
 
556 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  38.62 
 
 
528 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.71 
 
 
565 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 
510 aa  246  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.64 
 
 
527 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.59 
 
 
510 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.22 
 
 
479 aa  246  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.19 
 
 
532 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  36.51 
 
 
398 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  39.47 
 
 
540 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.3 
 
 
479 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.61 
 
 
453 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4920  DEAD/DEAH box helicase-like  39.69 
 
 
446 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126468  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.7 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.8 
 
 
571 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.61 
 
 
453 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.61 
 
 
453 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.47 
 
 
462 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.61 
 
 
453 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.29 
 
 
643 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  37.5 
 
 
527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  38.03 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.61 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.27 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  37.93 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.63 
 
 
541 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.8 
 
 
482 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  36.8 
 
 
482 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  36.68 
 
 
516 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.36 
 
 
527 aa  244  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>