More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9893 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_9893  predicted protein  100 
 
 
455 aa  919    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119572  Ddx49-related DEAD box helicase superfamily II protein  38.84 
 
 
417 aa  276  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.708695  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04903  ATP-dependent RNA helicase dbp8 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B3H7]  41.63 
 
 
525 aa  270  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01540  conserved hypothetical protein  37.3 
 
 
619 aa  270  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02850  ATP-dependent RNA helicase, putative  41.49 
 
 
484 aa  265  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  38.94 
 
 
465 aa  264  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  38.89 
 
 
466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40593  Dead-Box Protein 8, ATP-dependent helicase involved in rRNA processing  37.55 
 
 
445 aa  253  5.000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28984  predicted protein  39.35 
 
 
433 aa  248  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  37.97 
 
 
710 aa  226  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  37.97 
 
 
755 aa  226  9e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  37.66 
 
 
396 aa  218  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_1703  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  34.68 
 
 
672 aa  206  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.25 
 
 
486 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.23 
 
 
440 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.86 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.92 
 
 
509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.4 
 
 
498 aa  200  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1190  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.65 
 
 
462 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.56 
 
 
460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.26 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.73 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000132586  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.93 
 
 
452 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141763  normal  0.273496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.3 
 
 
484 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.74 
 
 
511 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.66 
 
 
466 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.3 
 
 
484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.91 
 
 
487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3791  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.13 
 
 
445 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.138512  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1158  ATP-dependent RNA helicase  36.88 
 
 
447 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  36.16 
 
 
492 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1587  ATP-dependent RNA helicase SrmB  37.13 
 
 
453 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4532  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.68 
 
 
440 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1538  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.01 
 
 
436 aa  195  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.93 
 
 
453 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512002  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2926  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.57 
 
 
468 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14032  predicted protein  37.05 
 
 
467 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.59 
 
 
514 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  35.15 
 
 
495 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3701  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.48 
 
 
467 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000590991  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
506 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4039  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.53 
 
 
453 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.541201 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
506 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  35.56 
 
 
506 aa  193  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12760  ATP-dependent RNA helicase  36.39 
 
 
449 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00382469  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0855  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.13 
 
 
478 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.521199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.58 
 
 
525 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  33.58 
 
 
528 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.58 
 
 
528 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  33.58 
 
 
528 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.58 
 
 
528 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  33.58 
 
 
525 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10125  ATP-dependent RNA helicase (Drs1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14990)  35.86 
 
 
814 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00305342  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.2 
 
 
443 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2335  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.25 
 
 
467 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0940399  normal  0.127544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  33.58 
 
 
533 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  33.58 
 
 
528 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  35.25 
 
 
527 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
538 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.57 
 
 
567 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.41 
 
 
560 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2004  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 
467 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0563026  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2052  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 
467 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.15758  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
438 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  33.33 
 
 
529 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.89 
 
 
530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  34.65 
 
 
398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0847  ATP-dependent RNA helicase DeaD  30.88 
 
 
478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.348098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.31 
 
 
581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.46 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0198  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.96 
 
 
418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  36.79 
 
 
513 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1989  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 
467 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.87 
 
 
486 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.25 
 
 
482 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.83 
 
 
425 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180837  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.41 
 
 
565 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.41 
 
 
504 aa  190  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.31 
 
 
451 aa  190  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  35.52 
 
 
540 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_006686  CND02650  conserved hypothetical protein  36.43 
 
 
808 aa  189  5.999999999999999e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2476  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.88 
 
 
461 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.753535  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.81 
 
 
498 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35 
 
 
522 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0750  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.16 
 
 
463 aa  189  8e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 
559 aa  189  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1273  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.22 
 
 
456 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1915  DEAD/DEAH box helicase  36.16 
 
 
393 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.36 
 
 
448 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3728  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.89 
 
 
447 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201471  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  33.84 
 
 
446 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.11 
 
 
529 aa  189  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001255  ATP-dependent RNA helicase  35.64 
 
 
443 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.42 
 
 
571 aa  188  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.03 
 
 
448 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00759671  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.93 
 
 
589 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3284  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.73 
 
 
412 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.22 
 
 
538 aa  188  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.99 
 
 
580 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.76 
 
 
494 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>