More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_1703 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_1703  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  100 
 
 		 672 aa  1356    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10125  ATP-dependent RNA helicase (Drs1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14990)  47.7 
 
 		 814 aa  497  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00305342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02650  conserved hypothetical protein  48.3 
 
 		 808 aa  450  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14032  predicted protein  46.46 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  41.52 
 
 		 710 aa  402  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  42.26 
 
 		 755 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.323573 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  37.24 
 
 		 465 aa  270  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.38 
 
 		 449 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.38 
 
 		 453 aa  267  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  37.33 
 
 		 567 aa  266  8.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.29 
 
 		 580 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.22 
 
 		 521 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.22 
 
 		 505 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.9 
 
 		 567 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.57 
 
 		 484 aa  265  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02850  ATP-dependent RNA helicase, putative  41.69 
 
 		 484 aa  263  6e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11921  putative ATP-dependent RNA helicase  33.89 
 
 		 595 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.412089  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  42.37 
 
 		 445 aa  263  8e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  40.16 
 
 		 516 aa  263  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.25 
 
 		 550 aa  263  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.69 
 
 		 535 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.54 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1112  DEAD/DEAH box helicase-like  39.83 
 
 		 593 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.446454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  42.54 
 
 		 484 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.4 
 
 		 501 aa  260  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.16 
 
 		 487 aa  259  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.1 
 
 		 556 aa  259  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.58 
 
 		 499 aa  259  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.68 
 
 		 578 aa  259  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.3 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.3 
 
 		 515 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.3 
 
 		 526 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  41.93 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  42.31 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.3 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1952  DEAD/DEAH box helicase-like  40.63 
 
 		 426 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.21 
 
 		 506 aa  258  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  40.16 
 
 		 492 aa  257  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  39.5 
 
 		 506 aa  257  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  40.22 
 
 		 607 aa  256  9e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  41.14 
 
 		 552 aa  256  9e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  42.3 
 
 		 398 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  39.39 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.68 
 
 		 549 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.41 
 
 		 549 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.63 
 
 		 519 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.39 
 
 		 499 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.23 
 
 		 537 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0145  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.38 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  38.92 
 
 		 477 aa  254  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.63 
 
 		 519 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.24 
 
 		 451 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0163  ATP-dependent RNA helicase  41.38 
 
 		 446 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.85 
 
 		 522 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.92 
 
 		 482 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.83 
 
 		 465 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  39.72 
 
 		 516 aa  254  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.94 
 
 		 640 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.68 
 
 		 494 aa  253  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.94 
 
 		 640 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.94 
 
 		 640 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.94 
 
 		 640 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1916  hypothetical protein  38.99 
 
 		 575 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1082  ATP-dependent DEAD/DEAH box RNA-helicase  40.71 
 
 		 567 aa  252  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12081  putative ATP-dependent RNA helicase  37.4 
 
 		 593 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.61 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.06 
 
 		 506 aa  253  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.68 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.94 
 
 		 640 aa  253  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  41.11 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.28 
 
 		 559 aa  252  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.73 
 
 		 452 aa  252  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.9 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.17 
 
 		 433 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.87 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  42.18 
 
 		 527 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12071  putative ATP-dependent RNA helicase  38.98 
 
 		 593 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.1 
 
 		 632 aa  251  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  40.73 
 
 		 503 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.05 
 
 		 545 aa  250  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  39.67 
 
 		 476 aa  250  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  40.88 
 
 		 609 aa  250  7e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.45 
 
 		 533 aa  250  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40877  predicted protein  39.2 
 
 		 546 aa  249  8e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  35.11 
 
 		 589 aa  250  8e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  37.67 
 
 		 466 aa  249  9e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.61 
 
 		 433 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.61 
 
 		 433 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.4 
 
 		 491 aa  249  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.61 
 
 		 433 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.61 
 
 		 433 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  38.68 
 
 		 485 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.41 
 
 		 423 aa  249  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.73 
 
 		 423 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.45 
 
 		 628 aa  249  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3364  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.19 
 
 		 419 aa  249  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.89 
 
 		 497 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.38 
 
 		 493 aa  249  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5192  DEAD/DEAH box helicase-like  40.85 
 
 		 507 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.89 
 
 		 504 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>