More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04233 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  100 
 
 
465 aa  956    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02850  ATP-dependent RNA helicase, putative  63.48 
 
 
484 aa  528  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  55.22 
 
 
466 aa  509  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  59.61 
 
 
396 aa  487  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28984  predicted protein  54.14 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119572  Ddx49-related DEAD box helicase superfamily II protein  41.85 
 
 
417 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.708695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.88 
 
 
466 aa  309  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  45.51 
 
 
755 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  45.51 
 
 
710 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.77 
 
 
511 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40593  Dead-Box Protein 8, ATP-dependent helicase involved in rRNA processing  41.47 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.61 
 
 
528 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  40.61 
 
 
528 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  40.61 
 
 
528 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.61 
 
 
528 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.61 
 
 
528 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  40.61 
 
 
533 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.61 
 
 
525 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.61 
 
 
525 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  43.01 
 
 
506 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.03 
 
 
538 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.47 
 
 
494 aa  299  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  39.85 
 
 
529 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.97 
 
 
504 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05770  DNA/RNA helicase, superfamily II  38.23 
 
 
551 aa  295  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000174624  hitchhiker  0.00467584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.9 
 
 
511 aa  294  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.47 
 
 
467 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.53 
 
 
453 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  41.95 
 
 
492 aa  294  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.94 
 
 
449 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.13 
 
 
513 aa  293  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.19 
 
 
482 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.11 
 
 
489 aa  292  7e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.69 
 
 
418 aa  291  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.2 
 
 
491 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.69 
 
 
559 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.41 
 
 
437 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.33 
 
 
487 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.12 
 
 
418 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.85 
 
 
418 aa  290  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.19 
 
 
383 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.78 
 
 
484 aa  289  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.78 
 
 
484 aa  289  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04903  ATP-dependent RNA helicase dbp8 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B3H7]  37.66 
 
 
525 aa  289  7e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.14 
 
 
555 aa  289  9e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.86 
 
 
525 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.86 
 
 
515 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.46 
 
 
485 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.86 
 
 
525 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.4 
 
 
589 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.86 
 
 
526 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.4 
 
 
448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.58 
 
 
486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.23 
 
 
550 aa  286  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.36 
 
 
492 aa  286  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12760  ATP-dependent RNA helicase  41.67 
 
 
449 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00382469  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.82 
 
 
519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  42.36 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.82 
 
 
519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.05 
 
 
557 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.05 
 
 
557 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.05 
 
 
557 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.48 
 
 
496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.96 
 
 
418 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  39.36 
 
 
637 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.51 
 
 
537 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.1 
 
 
564 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  42.25 
 
 
435 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 
550 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.83 
 
 
443 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  44.44 
 
 
469 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.64 
 
 
479 aa  283  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  41.73 
 
 
494 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.53 
 
 
454 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.78 
 
 
623 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.9 
 
 
494 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  42.2 
 
 
516 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1158  ATP-dependent RNA helicase  41.42 
 
 
447 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413431  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.32 
 
 
501 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.57 
 
 
466 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.67 
 
 
610 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.59 
 
 
482 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  42.74 
 
 
500 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.69 
 
 
486 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01540  conserved hypothetical protein  36.32 
 
 
619 aa  280  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.95 
 
 
453 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.89 
 
 
477 aa  280  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.89 
 
 
634 aa  280  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.44 
 
 
465 aa  279  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  40.14 
 
 
452 aa  279  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  40.6 
 
 
445 aa  279  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.15 
 
 
450 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000132586  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.35 
 
 
484 aa  279  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0819  DEAD/DEAH box helicase  40.97 
 
 
461 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.18 
 
 
599 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  39.95 
 
 
493 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  40.48 
 
 
589 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.12 
 
 
506 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  39.89 
 
 
495 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.42 
 
 
439 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>