More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0183 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  94.79 
 
 		 749 aa  1457    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  57.32 
 
 		 808 aa  904    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  100 
 
 		 749 aa  1518    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  76.11 
 
 		 776 aa  1172    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  94.67 
 
 		 751 aa  1436    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  41.4 
 
 		 769 aa  567  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  39.28 
 
 		 749 aa  538  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.65 
 
 		 756 aa  508  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  33.95 
 
 		 820 aa  487  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  33.13 
 
 		 829 aa  468  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  34.31 
 
 		 833 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  38.24 
 
 		 750 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  35.95 
 
 		 745 aa  464  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  32.3 
 
 		 851 aa  461  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  35.69 
 
 		 751 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  36.09 
 
 		 754 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  35.66 
 
 		 763 aa  445  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  40.43 
 
 		 938 aa  361  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  34.85 
 
 		 836 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 		 502 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  29.56 
 
 		 971 aa  207  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  30.45 
 
 		 1565 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  27.85 
 
 		 941 aa  198  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  30.06 
 
 		 1528 aa  191  5.999999999999999e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  27.38 
 
 		 551 aa  184  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  39.13 
 
 		 216 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  37.26 
 
 		 217 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  37.63 
 
 		 233 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  36.59 
 
 		 228 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 212 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  39.23 
 
 		 212 aa  108  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  37.91 
 
 		 212 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  37.91 
 
 		 212 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  37.02 
 
 		 212 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  34.02 
 
 		 230 aa  100  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  31.43 
 
 		 234 aa  98.2  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  25.86 
 
 		 555 aa  87.8  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  32.56 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  31.94 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  27.89 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  35.52 
 
 		 214 aa  79  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  35.9 
 
 		 211 aa  77.4  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  32.26 
 
 		 221 aa  76.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  24.25 
 
 		 560 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  25.17 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  32.22 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  24.48 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  24.42 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  24.02 
 
 		 560 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  24.42 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  24.02 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  24.02 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  24.02 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  24.02 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  24.48 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  35.56 
 
 		 215 aa  72.8  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  23.33 
 
 		 572 aa  70.5  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.88 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  31.94 
 
 		 905 aa  63.5  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1312  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  27.96 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  33.05 
 
 		 1013 aa  62.4  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  32.03 
 
 		 446 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  25.26 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0790  ATP-dependent RNA helicase SrmB  26.8 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.66 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.102362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3233  ATP-dependent RNA helicase SrmB  26.8 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0947  ATP-dependent RNA helicase SrmB  26.29 
 
 		 420 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.29 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4097  ATP-dependent RNA helicase SrmB  29.81 
 
 		 417 aa  60.1  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.872576  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1296  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.29 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1330  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.29 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3336  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.6 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10148  ATP-independent RNA helicase  28.85 
 
 		 437 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  36.09 
 
 		 877 aa  58.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  30.17 
 
 		 216 aa  59.3  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3058  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.29 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  31.93 
 
 		 158 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0970  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.03 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0448  DEAD/DEAH box helicase-like  31.1 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0687758  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001255  ATP-dependent RNA helicase  27.73 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001506  ATP-dependent RNA helicase  27.27 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000291883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2742  ATP-dependent RNA helicase SrmB  26.42 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05125  ATP-dependent RNA helicase  29.34 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  29.51 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0840  ATP-dependent RNA helicase SrmB  25.77 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3452  ATP-dependent RNA helicase SrmB  25.77 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3527  ATP-dependent RNA helicase SrmB  25.77 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  29.51 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3646  ATP-dependent RNA helicase SrmB  25.77 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05443  ATP-dependent RNA helicase  29.19 
 
 		 430 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  29.39 
 
 		 998 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  30 
 
 		 1046 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  32.17 
 
 		 554 aa  57.4  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl525  ATP-dependent RNA helicase  31.43 
 
 		 666 aa  56.6  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2718  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.45 
 
 		 413 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.695132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3331  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.56 
 
 		 441 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0290  nuclease  49.02 
 
 		 51 aa  56.6  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179128  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2952  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.63 
 
 		 419 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.47 
 
 		 507 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 		 1152 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>