61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2438 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  41.9 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  39.42 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  38.05 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  35.87 
 
 		 751 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  32.72 
 
 		 808 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  36.76 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.74 
 
 		 756 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  36.71 
 
 		 754 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  38.18 
 
 		 750 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  32.87 
 
 		 833 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  33.78 
 
 		 851 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  34.07 
 
 		 749 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  33.52 
 
 		 751 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  30.2 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  32.6 
 
 		 938 aa  98.6  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  32.56 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  33.18 
 
 		 763 aa  98.2  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  31.67 
 
 		 769 aa  98.2  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  31.43 
 
 		 749 aa  98.2  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  31.28 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  30.49 
 
 		 829 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  30.56 
 
 		 776 aa  92.8  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  33.65 
 
 		 745 aa  92.4  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  32.54 
 
 		 836 aa  91.3  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  31.67 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  30.7 
 
 		 820 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  34.12 
 
 		 749 aa  85.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0291  ERCC4  34.38 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  36.11 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  28.84 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  29.74 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  34.83 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  30.59 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  31.42 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  28.57 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  29.38 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  33.52 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  29.94 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  27.16 
 
 		 564 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42450  predicted protein  29.29 
 
 		 975 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.488375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  42.19 
 
 		 607 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  56.25 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0290  nuclease  51.11 
 
 		 51 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179128  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30908  excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4  30.08 
 
 		 975 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  45.76 
 
 		 656 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08713  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  28.18 
 
 		 985 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2177  DNA integrity scanning protein DisA  38.81 
 
 		 361 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441332  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  44.9 
 
 		 604 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  49.02 
 
 		 579 aa  45.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  46.94 
 
 		 597 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  41.07 
 
 		 620 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  41.07 
 
 		 620 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01820  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 		 1099 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  48.08 
 
 		 650 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  42.37 
 
 		 635 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0863  DNA integrity scanning protein DisA  35.14 
 
 		 362 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2725  excinuclease ABC subunit C  46.94 
 
 		 592 aa  42.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  44.26 
 
 		 674 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>