More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0800 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  70.17 
 
 		 836 aa  768    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  66 
 
 		 829 aa  1085    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  100 
 
 		 851 aa  1709    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  66.08 
 
 		 820 aa  1094    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  71.36 
 
 		 833 aa  1165    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  48.65 
 
 		 769 aa  501  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  33.33 
 
 		 749 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  45.93 
 
 		 938 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  46.29 
 
 		 749 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  32.66 
 
 		 749 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  31.19 
 
 		 808 aa  437  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  42.06 
 
 		 745 aa  436  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  41.03 
 
 		 750 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  42.49 
 
 		 754 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  41.83 
 
 		 751 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.37 
 
 		 756 aa  398  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  41.06 
 
 		 763 aa  392  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  35.35 
 
 		 751 aa  335  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  33.2 
 
 		 776 aa  320  9e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.7 
 
 		 502 aa  249  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  30.95 
 
 		 1565 aa  229  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  28.63 
 
 		 1528 aa  211  7e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  28.99 
 
 		 551 aa  209  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  26.85 
 
 		 971 aa  198  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  27.09 
 
 		 941 aa  188  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  37.5 
 
 		 217 aa  122  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  33.65 
 
 		 212 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  32.87 
 
 		 216 aa  103  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  33.78 
 
 		 234 aa  101  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  32.31 
 
 		 233 aa  98.6  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  31.46 
 
 		 212 aa  96.3  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  30.33 
 
 		 212 aa  95.9  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  32.86 
 
 		 230 aa  95.9  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  29.77 
 
 		 228 aa  90.9  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  33.18 
 
 		 215 aa  86.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.58 
 
 		 591 aa  72.4  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  29.78 
 
 		 211 aa  70.5  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  29.74 
 
 		 221 aa  70.1  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24549  predicted protein  34.23 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.31 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.31 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.31 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.31 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  29.03 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10380  Dicer-like protein 2 [Includes Endoribonuclease dcl2(EC 3.1.26.-);ATP-dependent helicase dcl2(EC 3.6.1.-)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C5H7]  31.18 
 
 		 1269 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917081  normal  0.453481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  31.45 
 
 		 446 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.57 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1320  excinuclease ABC subunit B  34.2 
 
 		 679 aa  66.6  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.350926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  28.9 
 
 		 246 aa  67  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.75 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.75 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.75 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.75 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  29.52 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.77 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000132586  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22900  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.38 
 
 		 657 aa  63.9  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3701  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.23 
 
 		 467 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000590991  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1226  excinuclease ABC, B subunit  38.66 
 
 		 657 aa  63.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.56679  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  63.5  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  63.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0950  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.08 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2576  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.48 
 
 		 422 aa  63.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  33.85 
 
 		 601 aa  63.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1998  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.64 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.21 
 
 		 678 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0291  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.73 
 
 		 577 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.279788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0341  DEAD/DEAH box helicase-like  30.33 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0103074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3711  putative ATP-dependent RNA helicase  32.14 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.33 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.43 
 
 		 441 aa  62  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94867  predicted protein  34.19 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0308188  normal  0.0300986 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  31.13 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0362  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.66 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0486542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2407  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.67 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2777  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.75 
 
 		 451 aa  62  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.54 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.08 
 
 		 422 aa  62  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  28.93 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1022  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.33 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284952 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  28.93 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.39 
 
 		 739 aa  61.6  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.29 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.29 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0808  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.88 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1242  excinuclease ABC, B subunit  35.9 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06640  Pre-mRNA splicing factor RNA helicase PRP28, putative  28.47 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.847821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3005  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.09 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2800  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.26 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1733  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27 
 
 		 712 aa  60.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1590  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.04 
 
 		 455 aa  60.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1501  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.88 
 
 		 456 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  23.12 
 
 		 460 aa  60.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2361  DEAD/DEAH box helicase-like  33.57 
 
 		 422 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1426  excinuclease ABC subunit B  35.2 
 
 		 678 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15057  predicted protein  38.94 
 
 		 654 aa  60.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252512  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.99 
 
 		 405 aa  60.8  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2928  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 		 487 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>