More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2407 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2361  DEAD/DEAH box helicase-like  81.2 
 
 		 422 aa  678    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2407  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 417 aa  825    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3579  DEAD/DEAH box helicase-like  70.77 
 
 		 421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0322  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.53 
 
 		 424 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.33 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.86 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.951835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03359  ATP-dependent RNA helicase  61.58 
 
 		 405 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.94 
 
 		 438 aa  438  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001496  ATP-dependent RNA helicase  50.12 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.64 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2938  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.64 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71109  normal  0.0696862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.39 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404894  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.91 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2495  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1460  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.12 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1745  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.62 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.13 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2710  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.37 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1422  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  50 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.219008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.22 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2529  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.22 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.49 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0112372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1434  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.24 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0565  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.4 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  52.86 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.86 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.86 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.86 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.86 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.86 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  52.86 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.86 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.6 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3401  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.38 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.571925  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.6 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.6 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.6 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.6 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.6 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.88 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.23 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.96 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.04 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0424079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.38 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.81 
 
 		 452 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1532  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  51.53 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.94 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.3 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  49.74 
 
 		 516 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  50.13 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.55 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3598  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.27 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.55 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.61 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.65 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.13 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.13 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.26 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.61 
 
 		 522 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.87 
 
 		 578 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.19 
 
 		 549 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.57 
 
 		 513 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  49.22 
 
 		 435 aa  363  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.52 
 
 		 456 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.97 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 		 550 aa  363  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.28 
 
 		 477 aa  363  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  49.49 
 
 		 429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.74 
 
 		 511 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.57 
 
 		 381 aa  362  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.52 
 
 		 496 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1885  ATP-dependent RNA helicase  48.56 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00339592  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.05 
 
 		 494 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.93 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0465  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.04 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4920  DEAD/DEAH box helicase-like  50.13 
 
 		 446 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  50.78 
 
 		 543 aa  359  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  48.44 
 
 		 445 aa  359  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.49 
 
 		 533 aa  359  6e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.78 
 
 		 515 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.29 
 
 		 491 aa  358  8e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  49.87 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0448  DEAD/DEAH box helicase-like  48.72 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0687758  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2898  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.3 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2810  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.3 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.61 
 
 		 486 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  46.44 
 
 		 495 aa  355  6.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  49.61 
 
 		 486 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.61 
 
 		 486 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.35 
 
 		 526 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.52 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.35 
 
 		 525 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.35 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.35 
 
 		 525 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.63 
 
 		 601 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1945  DEAD/DEAH box helicase-like  46.39 
 
 		 411 aa  355  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.35 
 
 		 480 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.31 
 
 		 491 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338708  normal  0.0711537 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.09 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.09 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>