More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1945 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1945  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 
411 aa  833    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0465  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.6 
 
 
407 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2361  DEAD/DEAH box helicase-like  45.93 
 
 
422 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122997  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2407  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.39 
 
 
417 aa  365  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3579  DEAD/DEAH box helicase-like  43.77 
 
 
421 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43 
 
 
427 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0322  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.7 
 
 
424 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2495  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.13 
 
 
427 aa  349  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1422  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  42.01 
 
 
427 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.219008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.36 
 
 
441 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1434  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.01 
 
 
427 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.77 
 
 
427 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0112372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.79 
 
 
427 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.79 
 
 
427 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404894  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.79 
 
 
427 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2938  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.54 
 
 
427 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71109  normal  0.0696862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1460  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.51 
 
 
442 aa  341  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2710  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.16 
 
 
428 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001496  ATP-dependent RNA helicase  41.32 
 
 
416 aa  334  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16101  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0565  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.65 
 
 
442 aa  333  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2529  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.08 
 
 
426 aa  332  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3329  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.88 
 
 
380 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.34 
 
 
432 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0424079 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  41.09 
 
 
398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3401  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.33 
 
 
432 aa  325  8.000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.571925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1745  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.08 
 
 
432 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.1 
 
 
417 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.59 
 
 
446 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.951835  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.71 
 
 
494 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.63 
 
 
506 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.76 
 
 
513 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.71 
 
 
511 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  41.84 
 
 
435 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.63 
 
 
425 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03359  ATP-dependent RNA helicase  41.48 
 
 
405 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.53 
 
 
477 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.46 
 
 
426 aa  316  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.98 
 
 
540 aa  316  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1532  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  41.3 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.29 
 
 
452 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.42 
 
 
628 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.47 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.85 
 
 
480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.11 
 
 
550 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  41.93 
 
 
445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.67 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.29 
 
 
533 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  43.25 
 
 
418 aa  312  5.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.59 
 
 
463 aa  312  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.85 
 
 
515 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.85 
 
 
525 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.85 
 
 
526 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.35 
 
 
418 aa  311  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.85 
 
 
525 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3364  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.86 
 
 
419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.41 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2189  putative ATP-dependent RNA helicase  40.89 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  39.37 
 
 
635 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2926  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.95 
 
 
468 aa  309  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.71 
 
 
626 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.15 
 
 
418 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3598  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.28 
 
 
381 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.76 
 
 
578 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  40.05 
 
 
516 aa  308  9e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.81 
 
 
479 aa  308  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.76 
 
 
549 aa  308  9e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  38.53 
 
 
639 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.42 
 
 
629 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.36 
 
 
443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.76 
 
 
549 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.01 
 
 
418 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.01 
 
 
418 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.51 
 
 
422 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  40.15 
 
 
629 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.7 
 
 
418 aa  306  6e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  40.15 
 
 
622 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.58 
 
 
496 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.6 
 
 
630 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  40.2 
 
 
495 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.22 
 
 
626 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  40 
 
 
540 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0429  putative ATP-dependent RNA helicase 1  39.23 
 
 
418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.37 
 
 
522 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  39.53 
 
 
543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5192  DEAD/DEAH box helicase-like  39.74 
 
 
507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4569  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.74 
 
 
483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0474956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.74 
 
 
507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.110628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.42 
 
 
627 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.26 
 
 
463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2862  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.11 
 
 
385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2004  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.92 
 
 
467 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0563026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.37 
 
 
485 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.43 
 
 
535 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2335  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.92 
 
 
467 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0940399  normal  0.127544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.27 
 
 
383 aa  302  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1989  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.67 
 
 
467 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1885  ATP-dependent RNA helicase  42.59 
 
 
388 aa  302  8.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00339592  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  38.07 
 
 
557 aa  302  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7264  DEAD/DEAH box helicase  39.74 
 
 
481 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.73 
 
 
515 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>