More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_35638 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  100 
 
 
551 aa  1146    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  37.89 
 
 
1565 aa  343  4e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  35.41 
 
 
971 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  35.14 
 
 
1528 aa  325  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  34.63 
 
 
941 aa  314  2.9999999999999996e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.14 
 
 
756 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  30.89 
 
 
769 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  29.17 
 
 
749 aa  239  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  33.65 
 
 
745 aa  233  9e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  30.48 
 
 
938 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  31.75 
 
 
750 aa  224  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  29.82 
 
 
836 aa  219  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  30.83 
 
 
751 aa  213  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  29.19 
 
 
754 aa  210  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  28.99 
 
 
851 aa  209  9e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  31.26 
 
 
763 aa  207  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  28.68 
 
 
820 aa  200  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  27.76 
 
 
829 aa  195  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  29.55 
 
 
776 aa  193  6e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  28.36 
 
 
833 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  27.84 
 
 
749 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  27.38 
 
 
749 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  27.18 
 
 
751 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.33 
 
 
502 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  26.18 
 
 
808 aa  160  6e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  47.37 
 
 
493 aa  64.7  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.34 
 
 
607 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  43.06 
 
 
396 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.05 
 
 
556 aa  60.5  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  30.11 
 
 
518 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.11 
 
 
516 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.83 
 
 
493 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.46 
 
 
538 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.11 
 
 
507 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  34.58 
 
 
601 aa  58.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  46.67 
 
 
710 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  46.67 
 
 
755 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.9 
 
 
556 aa  57  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.11 
 
 
465 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.44 
 
 
528 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.989648  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10380  Dicer-like protein 2 [Includes Endoribonuclease dcl2(EC 3.1.26.-);ATP-dependent helicase dcl2(EC 3.6.1.-)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C5H7]  28.57 
 
 
1269 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917081  normal  0.453481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0914  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.66 
 
 
447 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3057  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.16 
 
 
577 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.48 
 
 
504 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0155  ATP-dependent RNA helicase RhlB  39 
 
 
428 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2715  putative ATP-dependent RNA helicase  37.63 
 
 
434 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511993  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0158  ATP-dependent RNA helicase RhlB  44.74 
 
 
428 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.67 
 
 
505 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.55 
 
 
439 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  38.64 
 
 
484 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.66 
 
 
521 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.89 
 
 
519 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4013  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
430 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4205  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
430 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.25 
 
 
451 aa  54.7  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.89 
 
 
519 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40593  Dead-Box Protein 8, ATP-dependent helicase involved in rRNA processing  36.96 
 
 
445 aa  55.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0754  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.1 
 
 
447 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0016093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.11 
 
 
482 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_1794  predicted protein  40.24 
 
 
421 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00327182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.85 
 
 
447 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.48 
 
 
532 aa  54.7  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.47 
 
 
567 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1950  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.03 
 
 
522 aa  54.3  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.79 
 
 
585 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.11 
 
 
565 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27821  predicted protein  46.38 
 
 
822 aa  54.3  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  41.98 
 
 
465 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.69 
 
 
527 aa  53.9  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  28.57 
 
 
590 aa  53.9  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.83 
 
 
546 aa  53.9  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  37.66 
 
 
580 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.11 
 
 
565 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.76 
 
 
527 aa  53.9  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4144  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.47 
 
 
580 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4303  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0431153  normal  0.722207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03658  ATP-dependent RNA helicase  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000314324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00222167  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  42.25 
 
 
428 aa  53.9  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3996  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4223  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0291518  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.23 
 
 
591 aa  53.9  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0146  ATP-dependent RNA helicase RhlB  31.3 
 
 
434 aa  53.9  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00149472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.89 
 
 
501 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  42.11 
 
 
565 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4195  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5213  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03607  hypothetical protein  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000127308  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  34.67 
 
 
460 aa  53.9  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4005  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00596063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4126  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
421 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.11 
 
 
498 aa  53.5  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.25 
 
 
405 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0178  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.42 
 
 
428 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  27.59 
 
 
1052 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>