More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1060 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  54.78 
 
 		 763 aa  810    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  61.49 
 
 		 751 aa  925    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  100 
 
 		 754 aa  1533    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  57.07 
 
 		 750 aa  843    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  61.09 
 
 		 745 aa  935    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  42.58 
 
 		 769 aa  629  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  43.77 
 
 		 749 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  40.46 
 
 		 820 aa  570  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.37 
 
 		 756 aa  541  9.999999999999999e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  36.26 
 
 		 751 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  36.09 
 
 		 749 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  49.22 
 
 		 938 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  36.22 
 
 		 749 aa  459  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  34.01 
 
 		 776 aa  430  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  43.59 
 
 		 829 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  42.49 
 
 		 851 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  40 
 
 		 836 aa  404  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  32.05 
 
 		 808 aa  399  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  40.99 
 
 		 833 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.48 
 
 		 502 aa  301  4e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  29.75 
 
 		 971 aa  225  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  29.19 
 
 		 551 aa  210  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  31.06 
 
 		 1565 aa  206  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  31.2 
 
 		 1528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  34.67 
 
 		 941 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  33.99 
 
 		 217 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  35.94 
 
 		 234 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  31.46 
 
 		 233 aa  103  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 212 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  28.37 
 
 		 216 aa  99.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  35.16 
 
 		 246 aa  98.2  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 212 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 212 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  32.97 
 
 		 219 aa  95.1  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  30.14 
 
 		 230 aa  92.8  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  92  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  34.15 
 
 		 212 aa  90.5  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  29 
 
 		 228 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  31.55 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  32.8 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  30.68 
 
 		 211 aa  79  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  30.14 
 
 		 221 aa  75.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0855  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.03 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.521199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0847  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.03 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.348098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  28.28 
 
 		 215 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.65 
 
 		 574 aa  72  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  29.51 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1190  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.22 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107478 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  37.72 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.06 
 
 		 567 aa  68.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  32.06 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  35.19 
 
 		 706 aa  67.4  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.23 
 
 		 580 aa  67.4  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2800  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.9 
 
 		 505 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  33.06 
 
 		 484 aa  67.4  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19120  ATP-dependent DEAD/DEAH box helicase  35.81 
 
 		 439 aa  67  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2643  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.88 
 
 		 533 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2742  ATP-dependent RNA helicase SrmB  36.11 
 
 		 613 aa  67  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.69 
 
 		 545 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28984  predicted protein  34.75 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3711  putative ATP-dependent RNA helicase  36 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  29.94 
 
 		 579 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.8 
 
 		 591 aa  66.6  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 626 aa  65.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06640  Pre-mRNA splicing factor RNA helicase PRP28, putative  30.77 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.847821  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 644 aa  65.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2480  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.045241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 		 567 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1680  ATP-dependent RNA helicase DbpA  26.4 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240536  normal  0.0183656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  35.16 
 
 		 659 aa  65.1  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.17 
 
 		 787 aa  64.7  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1775  ATP-dependent RNA helicase DbpA  26.4 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0367787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1838  ATP-dependent RNA helicase DbpA  26.4 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.787138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.71 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  22.94 
 
 		 560 aa  64.7  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0840  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.94 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3452  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.94 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3527  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.94 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3646  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.94 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 		 687 aa  64.3  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2576  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.85 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0420  superfamily II DNA/RNA helicase  32.73 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3036  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  29.87 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.72 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4532  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.72 
 
 		 440 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.4 
 
 		 545 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.61 
 
 		 609 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  30.83 
 
 		 669 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0359  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.992502  normal  0.993295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4039  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.72 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541201 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0744  ATP-dependent RNA helicase SrmB  32.28 
 
 		 411 aa  63.9  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03093  ATP-dependent RNA helicase SrmB  30 
 
 		 408 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.64 
 
 		 452 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141763  normal  0.273496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2796  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.67 
 
 		 423 aa  63.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19290  putative ATP-dependent RNA helicase  32.68 
 
 		 446 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2777  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.25 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>