27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01820 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH01820  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1099 aa  2271    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08713  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  32.94 
 
 		 985 aa  302  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  34.15 
 
 		 564 aa  292  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42450  predicted protein  37.67 
 
 		 975 aa  233  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.488375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30908  excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4  35.05 
 
 		 975 aa  223  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_19389  predicted protein  33.55 
 
 		 388 aa  144  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000708555 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  29.68 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  34.09 
 
 		 938 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  40 
 
 		 233 aa  57.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  36.14 
 
 		 769 aa  56.6  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.66 
 
 		 756 aa  53.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  41.46 
 
 		 829 aa  52  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  33.33 
 
 		 216 aa  51.6  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  35.9 
 
 		 230 aa  52  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 211 aa  51.6  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  33.33 
 
 		 820 aa  50.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  36.71 
 
 		 246 aa  49.7  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  35.43 
 
 		 749 aa  48.5  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  32.26 
 
 		 851 aa  47  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  38.78 
 
 		 749 aa  46.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  36.67 
 
 		 776 aa  46.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  37.76 
 
 		 751 aa  45.8  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  29.17 
 
 		 833 aa  45.8  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  26.49 
 
 		 749 aa  45.4  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  21.96 
 
 		 971 aa  45.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  30.91 
 
 		 808 aa  45.1  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  22.27 
 
 		 941 aa  44.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>