53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2814 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  100 
 
 		 220 aa  433  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  30.14 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  31.25 
 
 		 751 aa  82  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  28.97 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  28.97 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  29.86 
 
 		 763 aa  78.2  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  29.91 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  28.57 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  28.17 
 
 		 750 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  27.62 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  30.05 
 
 		 769 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  31.42 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  28.24 
 
 		 745 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  29.05 
 
 		 833 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  26.75 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  23.92 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  26.49 
 
 		 751 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  26.39 
 
 		 808 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  25.71 
 
 		 749 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  30.39 
 
 		 829 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  25.26 
 
 		 749 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  29.26 
 
 		 749 aa  60.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  31.67 
 
 		 820 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  27.27 
 
 		 836 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  24.42 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  26.89 
 
 		 938 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  25.98 
 
 		 851 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  23.47 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0291  ERCC4  33.61 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  28.77 
 
 		 754 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  27.07 
 
 		 776 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.95 
 
 		 756 aa  52.8  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  31.87 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  27.15 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  29.11 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  29.11 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  30.11 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2845  excinuclease ABC subunit C  44 
 
 		 762 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  21.72 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  27.44 
 
 		 343 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  40.32 
 
 		 681 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  28.19 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  23.22 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  34.38 
 
 		 780 aa  44.3  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  45.45 
 
 		 604 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  38.46 
 
 		 673 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  30.28 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 		 579 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  34.18 
 
 		 708 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  30.43 
 
 		 615 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  43.18 
 
 		 597 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  32.84 
 
 		 744 aa  42  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  32.84 
 
 		 744 aa  42  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>