42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3788 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  72.96 
 
 		 158 aa  246  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2504  hypothetical protein  36.24 
 
 		 178 aa  103  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3998  hypothetical protein  35.92 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00055728  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2422  hypothetical protein  35.92 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0086  hypothetical protein  39.53 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.176439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4379  ERCC4  38.35 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5359  cyclic nucleotide-binding protein  38.67 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12549  hypothetical protein  34.31 
 
 		 463 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0306994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2880  ERCC4 domain protein  33.09 
 
 		 322 aa  64.3  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5189  ERCC4 domain-containing protein  32.39 
 
 		 325 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  31.45 
 
 		 749 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  30.33 
 
 		 751 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  31.67 
 
 		 776 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  30.77 
 
 		 808 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  29.51 
 
 		 749 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1537  hypothetical protein  27.89 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.578117  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.61 
 
 		 756 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3806  ERCC4 domain-containing protein  29.73 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  28.7 
 
 		 749 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  33.04 
 
 		 833 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  34.15 
 
 		 829 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  29.84 
 
 		 938 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  30.88 
 
 		 820 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  29.11 
 
 		 220 aa  50.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  30.23 
 
 		 769 aa  50.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  33.96 
 
 		 851 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  39.13 
 
 		 836 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  29.41 
 
 		 745 aa  47.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  29.75 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  28.26 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  28.57 
 
 		 763 aa  45.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  25.93 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03490  hypothetical protein  23.53 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  27.5 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  25.37 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  25.37 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  30.69 
 
 		 754 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  36.78 
 
 		 751 aa  42.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  26.89 
 
 		 212 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0291  ERCC4  28.57 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>