22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5189 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5189  ERCC4 domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5359  cyclic nucleotide-binding protein  71.12 
 
 		 321 aa  434  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12549  hypothetical protein  60.68 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0306994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2880  ERCC4 domain protein  50.16 
 
 		 322 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00644974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3806  ERCC4 domain-containing protein  53.23 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1537  hypothetical protein  29.54 
 
 		 354 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.578117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  32.39 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  32.39 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  32.85 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  31.15 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  31.15 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2504  hypothetical protein  30.92 
 
 		 178 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2422  hypothetical protein  30.37 
 
 		 159 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3998  hypothetical protein  30.37 
 
 		 159 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00055728  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4379  ERCC4  27.5 
 
 		 190 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0086  hypothetical protein  35.4 
 
 		 177 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.176439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  25.17 
 
 		 749 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  30.33 
 
 		 212 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  29.51 
 
 		 212 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0218  putative Lsr2-like protein  54.84 
 
 		 134 aa  42.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  24.37 
 
 		 776 aa  42.4  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  21.92 
 
 		 751 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>