14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2422 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2422  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  326  8e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3998  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  326  8e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00055728  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2504  hypothetical protein  85.52 
 
 		 178 aa  253  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0086  hypothetical protein  41.18 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.176439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  39.85 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  35.92 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  35.92 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4379  ERCC4  35.97 
 
 		 190 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5359  cyclic nucleotide-binding protein  34.31 
 
 		 321 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03490  hypothetical protein  28 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12549  hypothetical protein  32.35 
 
 		 463 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0306994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5189  ERCC4 domain-containing protein  30.37 
 
 		 325 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3806  ERCC4 domain-containing protein  25.37 
 
 		 330 aa  48.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2880  ERCC4 domain protein  26.81 
 
 		 322 aa  47.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00644974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>