17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12549 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12549  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  931    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0306994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5189  ERCC4 domain-containing protein  60.68 
 
 		 325 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5359  cyclic nucleotide-binding protein  61.37 
 
 		 321 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3806  ERCC4 domain-containing protein  54.87 
 
 		 330 aa  315  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2880  ERCC4 domain protein  47.19 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1537  hypothetical protein  29.78 
 
 		 354 aa  113  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.578117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  34.31 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  35.61 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4379  ERCC4  27.33 
 
 		 190 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3998  hypothetical protein  32.35 
 
 		 159 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00055728  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2422  hypothetical protein  32.35 
 
 		 159 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2504  hypothetical protein  30.08 
 
 		 178 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3417  hypothetical protein  60 
 
 		 111 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0218  putative Lsr2-like protein  51.61 
 
 		 134 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  26.72 
 
 		 776 aa  43.5  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6389  hypothetical protein  54.29 
 
 		 264 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.338127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>