80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3417 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3417  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  224  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9149  hypothetical protein  64.86 
 
 		 110 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2877  putative Lsr2-like protein  59.46 
 
 		 111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2868  putative Lsr2-like protein  56.64 
 
 		 110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4991  putative Lsr2-like protein  59.46 
 
 		 113 aa  126  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.916014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2977  putative Lsr2-like protein  54.95 
 
 		 111 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17040  hypothetical protein  54.7 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.482925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4476  hypothetical protein  57.66 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0722  hypothetical protein  54.05 
 
 		 111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201789  normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35520  hypothetical protein  55.26 
 
 		 115 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0788848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0856  hypothetical protein  50.42 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5750  hypothetical protein  53.98 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138689  normal  0.477611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31950  hypothetical protein  51.35 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0578  hypothetical protein  46.28 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0904277  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2090  hypothetical protein  54.05 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2975  hypothetical protein  49.55 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5649  hypothetical protein  50.45 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0465  hypothetical protein  49.55 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0643  hypothetical protein  51.3 
 
 		 115 aa  105  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458695  normal  0.189817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0638  protein lsr2 precursor  49.57 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0167  Lsr2-like protein  46.85 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3498  putative Lsr2-like protein  52.21 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.494087  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1245  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  48.67 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0330  hypothetical protein  46.43 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2248  hypothetical protein  45.54 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.262932  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3128  hypothetical protein  47.01 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1860  LSR2-like protein  49.09 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2105  hypothetical protein  44.55 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0972155  normal  0.454752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0218  putative Lsr2-like protein  44.03 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0331  Lsr2-like protein  45.05 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6765  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  49.56 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0525  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  50.44 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1774  putative Lsr2-like protein  47.22 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0240  protein lsr2 precursor  47.22 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036159  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6310  hypothetical protein  45.22 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4562  LSR2-like protein  45.05 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.282201 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3996  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  49.51 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0730  putative Lsr2-like protein  48.18 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1178  iron-regulated LSR2 protein precursor  45.05 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2972  iron-regulated LSR2 protein precursor  45.05 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2925  hypothetical protein  45.3 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.150841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24640  hypothetical protein  45.05 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4546  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  48.7 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0572  Lsr2 protein  46.09 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01530  hypothetical protein  42.73 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1647  iron-regulated LSR2 protein precursor  43.64 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214111  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12910  hypothetical protein  51.35 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0677059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5143  Lsr2  46.61 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4843  Lsr2  46.61 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4514  hypothetical protein  45.95 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13630  iron-regulated lsr2 protein precursor  49.55 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.5800500000000003e-77  normal  0.0370238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4757  Lsr2  46.61 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212965  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3448  LSR2-like protein  46.36 
 
 		 109 aa  93.2  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.326463  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4927  hypothetical protein  44.55 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0602  LSR2-like protein  44.25 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.332934  normal  0.0508474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4710  hypothetical protein  44.55 
 
 		 116 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4419  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1429  Lsr2  42.48 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467931  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4276  hypothetical protein  44.95 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5359  Lsr2  46.43 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2670  hypothetical protein  39.82 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000070834  normal  0.0381923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2237  hypothetical protein  43.12 
 
 		 194 aa  83.6  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8373  Lsr2 protein  43.36 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5452  Lsr2  40.74 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3406  hypothetical protein  40.71 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2426  hypothetical protein  39.29 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000395226  normal  0.0109582 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13170  hypothetical protein  39.29 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4553  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  45 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0771  hypothetical protein  35.14 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1058  hypothetical protein  34.48 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4175  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10230  hypothetical protein  44.78 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6389  hypothetical protein  57.89 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2611  hypothetical protein  43.55 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12549  hypothetical protein  60 
 
 		 463 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0306994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  51.35 
 
 		 1575 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  63.33 
 
 		 1348 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  56.25 
 
 		 1277 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5359  cyclic nucleotide-binding protein  51.52 
 
 		 321 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2880  ERCC4 domain protein  58.62 
 
 		 322 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00644974  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.51 
 
 		 547 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>