More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2129 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 
547 aa  1074    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.67 
 
 
405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.33 
 
 
410 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.78 
 
 
406 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3860  DNA polymerase III epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease-like protein  35.53 
 
 
407 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.83 
 
 
204 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.36 
 
 
328 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  41.82 
 
 
516 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  41.52 
 
 
389 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.31 
 
 
715 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.18 
 
 
224 aa  103  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0436  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.1 
 
 
339 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0464133  normal  0.956681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.38 
 
 
502 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1624  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.75 
 
 
298 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00188166  normal  0.266938 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  36.88 
 
 
954 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  38.55 
 
 
611 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.08 
 
 
462 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.26 
 
 
590 aa  99.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.06 
 
 
466 aa  98.2  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.18 
 
 
463 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  28.22 
 
 
1397 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.62 
 
 
449 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 
1433 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.34 
 
 
476 aa  93.6  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.42 
 
 
459 aa  93.6  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7047  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.14 
 
 
382 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  32.1 
 
 
970 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  35.85 
 
 
330 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  35.85 
 
 
330 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 
330 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  29.05 
 
 
1407 aa  92  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  32.1 
 
 
1433 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  32.1 
 
 
1433 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  32.1 
 
 
1433 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  32.1 
 
 
1433 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9062  DNA-directed DNA polymerase  40.31 
 
 
189 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  32.1 
 
 
1433 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 
1449 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  32.1 
 
 
1433 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  32.6 
 
 
345 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  33.95 
 
 
1402 aa  90.9  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  32.1 
 
 
1433 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  32.1 
 
 
1433 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  32.1 
 
 
1433 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 
1449 aa  90.9  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  37.5 
 
 
921 aa  90.5  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  36.08 
 
 
720 aa  90.1  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  32.32 
 
 
1436 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  32.32 
 
 
1438 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.84 
 
 
398 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  32.32 
 
 
1438 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.59 
 
 
442 aa  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.87 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2347  exonuclease  37.5 
 
 
313 aa  89.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.33 
 
 
482 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 
333 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  31.16 
 
 
1442 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  32.1 
 
 
1435 aa  88.6  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  41.51 
 
 
203 aa  88.6  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13743  DNA polymerase III subunit epsilon  35.67 
 
 
329 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000832595  normal  0.511972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  37.27 
 
 
379 aa  87.8  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  30.11 
 
 
1433 aa  87.4  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.36 
 
 
481 aa  87.4  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.24 
 
 
530 aa  87  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.8 
 
 
909 aa  87  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  34.44 
 
 
578 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.73 
 
 
934 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.73 
 
 
934 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.73 
 
 
934 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.73 
 
 
934 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.72 
 
 
565 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.73 
 
 
934 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.73 
 
 
934 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  28.8 
 
 
1447 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0524  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.12 
 
 
835 aa  85.9  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00517102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.09 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.18 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.79 
 
 
769 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.73 
 
 
934 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.12 
 
 
201 aa  85.9  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  32.32 
 
 
1432 aa  85.5  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  37.16 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.91 
 
 
929 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.65 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.53 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  34.57 
 
 
1444 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  40.12 
 
 
719 aa  84.7  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  31.87 
 
 
791 aa  84.7  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.41 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  28.22 
 
 
1367 aa  84.7  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.97 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  35.71 
 
 
590 aa  84.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  28.22 
 
 
1367 aa  84.3  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.14 
 
 
934 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.14 
 
 
934 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.35 
 
 
610 aa  84.3  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  29.38 
 
 
1465 aa  84  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  31.06 
 
 
457 aa  84  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  31.25 
 
 
1440 aa  84  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  34.9 
 
 
530 aa  83.6  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>