More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1339 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 201 aa  416  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1004  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.6 
 
 		 282 aa  114  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.8 
 
 		 769 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  34.07 
 
 		 485 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  31.02 
 
 		 707 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  32.09 
 
 		 570 aa  99  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.16 
 
 		 706 aa  99  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.07 
 
 		 719 aa  98.2  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  32.62 
 
 		 729 aa  98.2  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.78 
 
 		 237 aa  97.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.05 
 
 		 731 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.28 
 
 		 729 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 595 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.97 
 
 		 235 aa  96.3  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  33.68 
 
 		 719 aa  95.9  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  35.16 
 
 		 1367 aa  95.5  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.95 
 
 		 253 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  35.16 
 
 		 1367 aa  95.1  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  30.39 
 
 		 551 aa  95.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.67 
 
 		 721 aa  94.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  32.07 
 
 		 590 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.71 
 
 		 236 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  35.63 
 
 		 516 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.63 
 
 		 722 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  28.57 
 
 		 645 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  37.95 
 
 		 1365 aa  93.6  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1993  DNA-directed DNA polymerase  36.31 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000133992  hitchhiker  0.00000148516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.42 
 
 		 236 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  32.42 
 
 		 1433 aa  92.8  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.71 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000174809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2111  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.93 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000449377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.55 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.65 
 
 		 238 aa  92  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2607  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.31 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000048711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.31 
 
 		 242 aa  91.7  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.63 
 
 		 595 aa  91.7  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.96 
 
 		 459 aa  91.3  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2402  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.71 
 
 		 242 aa  91.3  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000797972  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1384  Rad3-related DNA helicase  29.83 
 
 		 797 aa  91.3  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  31.79 
 
 		 1440 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.57 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.7 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  32.78 
 
 		 1442 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  30.48 
 
 		 578 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1099  Rad3-related DNA helicase  30.77 
 
 		 489 aa  90.5  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.829267  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.94 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.21 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.53 
 
 		 240 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.64 
 
 		 232 aa  89.4  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.1 
 
 		 481 aa  89.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  33.7 
 
 		 236 aa  89.4  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.7 
 
 		 609 aa  89.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0478  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.72 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.58 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  30.43 
 
 		 720 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.94 
 
 		 218 aa  88.6  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  31.52 
 
 		 1390 aa  89  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.69 
 
 		 565 aa  88.6  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  30.73 
 
 		 603 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  31.02 
 
 		 574 aa  88.6  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  32.42 
 
 		 1447 aa  88.6  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1780  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.93 
 
 		 242 aa  88.6  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0978  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.32 
 
 		 280 aa  88.2  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0235504  normal  0.0652516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.76 
 
 		 462 aa  88.2  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  32.11 
 
 		 585 aa  88.2  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  32.08 
 
 		 527 aa  87.8  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  28.8 
 
 		 601 aa  87.8  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  28.57 
 
 		 1397 aa  87.8  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  36.42 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  32.53 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2323  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.93 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00003917  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.08 
 
 		 532 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2015  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.93 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000147945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2000  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.93 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000879357  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0149  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.93 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2063  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.93 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000471549  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  31.87 
 
 		 250 aa  86.7  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  30 
 
 		 1436 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  30.69 
 
 		 566 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  30.34 
 
 		 1438 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  30.34 
 
 		 1438 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.95 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.1 
 
 		 328 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2559  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.93 
 
 		 242 aa  85.9  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.81 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  30.94 
 
 		 1407 aa  85.9  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  32.29 
 
 		 584 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.95 
 
 		 232 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.12 
 
 		 547 aa  85.9  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2157  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000679182  normal  0.0877249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2234  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.53 
 
 		 267 aa  85.5  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.95 
 
 		 463 aa  85.9  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.3 
 
 		 442 aa  85.9  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.94 
 
 		 238 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  35.4 
 
 		 241 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.73 
 
 		 398 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  28.27 
 
 		 1388 aa  85.5  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>