More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2426 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 719 aa  1403    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.99 
 
 		 731 aa  646    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.38 
 
 		 722 aa  671    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  59.11 
 
 		 706 aa  742    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.15 
 
 		 769 aa  650    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.46 
 
 		 729 aa  592  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.54 
 
 		 721 aa  568  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  35.91 
 
 		 707 aa  345  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  38.84 
 
 		 729 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  35.97 
 
 		 719 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 714 aa  294  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.67 
 
 		 695 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  33.39 
 
 		 695 aa  244  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  45 
 
 		 616 aa  244  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.22 
 
 		 695 aa  243  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  46.58 
 
 		 485 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.74 
 
 		 659 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.09 
 
 		 479 aa  171  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.45 
 
 		 247 aa  134  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  40.37 
 
 		 236 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  39.13 
 
 		 1440 aa  127  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  37.93 
 
 		 1442 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  34.76 
 
 		 1407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  36.41 
 
 		 1365 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1848  DNA-directed DNA polymerase  35.41 
 
 		 233 aa  120  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  37.57 
 
 		 1449 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  33.83 
 
 		 1367 aa  117  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  33.83 
 
 		 1367 aa  117  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  37.02 
 
 		 1449 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  35.2 
 
 		 1465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  35.56 
 
 		 1433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.33 
 
 		 944 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.03 
 
 		 236 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  35.33 
 
 		 1421 aa  114  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  35.71 
 
 		 1527 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  35.35 
 
 		 1447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  37.31 
 
 		 1362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.23 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  33.51 
 
 		 1390 aa  111  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.1 
 
 		 565 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  35.76 
 
 		 239 aa  111  5e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.77 
 
 		 498 aa  111  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.59 
 
 		 921 aa  110  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  37.74 
 
 		 578 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.18 
 
 		 595 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.06 
 
 		 186 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.33 
 
 		 956 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.06 
 
 		 186 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  35.1 
 
 		 1468 aa  108  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  35.2 
 
 		 1397 aa  107  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.29 
 
 		 236 aa  107  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.69 
 
 		 236 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.69 
 
 		 241 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.64 
 
 		 231 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.55 
 
 		 235 aa  105  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  34.9 
 
 		 1464 aa  105  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  37.8 
 
 		 315 aa  105  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.96 
 
 		 239 aa  105  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  38.01 
 
 		 1402 aa  105  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  37.3 
 
 		 570 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  37.58 
 
 		 315 aa  104  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  34.71 
 
 		 1432 aa  104  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  31.28 
 
 		 1435 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.46 
 
 		 231 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  37.2 
 
 		 315 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  36.75 
 
 		 315 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.1 
 
 		 239 aa  103  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  37.2 
 
 		 315 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.64 
 
 		 231 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1004  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.96 
 
 		 282 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  36.78 
 
 		 720 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 		 238 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  36.75 
 
 		 315 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.27 
 
 		 226 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.64 
 
 		 228 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  37.2 
 
 		 315 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  37.2 
 
 		 315 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.36 
 
 		 237 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  38.89 
 
 		 299 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  37.2 
 
 		 315 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.97 
 
 		 239 aa  102  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  38.25 
 
 		 551 aa  101  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.62 
 
 		 610 aa  101  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  31.67 
 
 		 1436 aa  101  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.28 
 
 		 230 aa  101  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.18 
 
 		 229 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  40.32 
 
 		 584 aa  100  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2858  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.87 
 
 		 243 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.629828  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  37.28 
 
 		 230 aa  100  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  38.19 
 
 		 590 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0478  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.3 
 
 		 184 aa  100  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  36.59 
 
 		 315 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  34.38 
 
 		 527 aa  100  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.24 
 
 		 240 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  37.58 
 
 		 229 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.64 
 
 		 232 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.59 
 
 		 238 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  31.28 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  32.84 
 
 		 1426 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.55 
 
 		 237 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>