More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1911 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  48.52 
 
 
1210 aa  847    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  50.99 
 
 
1444 aa  1478    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  49.01 
 
 
1436 aa  1405    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  50.54 
 
 
1433 aa  1459    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  44.97 
 
 
1362 aa  985    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  44.92 
 
 
970 aa  845    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  44.87 
 
 
1367 aa  993    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  100 
 
 
1468 aa  3055    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  36.31 
 
 
1442 aa  801    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  42.14 
 
 
1388 aa  980    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  50.27 
 
 
1433 aa  1462    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  50.34 
 
 
1433 aa  1464    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  37.65 
 
 
1493 aa  972    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  41.16 
 
 
1465 aa  935    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  50.27 
 
 
1433 aa  1462    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  44.87 
 
 
1367 aa  992    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  49.15 
 
 
1438 aa  1395    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  50.72 
 
 
1443 aa  1476    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  39.82 
 
 
1365 aa  922    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  49.15 
 
 
1438 aa  1395    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  42.2 
 
 
1421 aa  991    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  49.9 
 
 
1433 aa  1453    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  50.27 
 
 
1433 aa  1462    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  44.6 
 
 
1527 aa  1056    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  38.35 
 
 
1479 aa  991    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  47.93 
 
 
1214 aa  829    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  43.6 
 
 
1447 aa  1076    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  37.22 
 
 
1438 aa  881    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  50.27 
 
 
1433 aa  1462    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  46.69 
 
 
1442 aa  1141    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  49.86 
 
 
1433 aa  1454    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  43.49 
 
 
1390 aa  965    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  46.79 
 
 
1440 aa  1197    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  46.11 
 
 
1397 aa  1123    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  46.77 
 
 
1433 aa  1146    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  44.03 
 
 
1449 aa  1151    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  44.26 
 
 
1449 aa  1152    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  44.62 
 
 
1407 aa  1170    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  50.48 
 
 
1433 aa  1465    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  47.32 
 
 
1212 aa  801    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  50.14 
 
 
1433 aa  1460    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  51.47 
 
 
1435 aa  1490    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  66.53 
 
 
1635 aa  1750    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  48.11 
 
 
1437 aa  1155    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  46.93 
 
 
1432 aa  1332    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  45.5 
 
 
1437 aa  1296    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  76.36 
 
 
1464 aa  2348    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  47.13 
 
 
1402 aa  1124    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  46.05 
 
 
1426 aa  1129    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  61.38 
 
 
483 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  37.67 
 
 
989 aa  576  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  23.11 
 
 
1170 aa  139  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.61 
 
 
1170 aa  139  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  23.26 
 
 
1170 aa  136  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  23.02 
 
 
1148 aa  135  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  22.5 
 
 
1127 aa  135  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  41.72 
 
 
560 aa  133  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  40.11 
 
 
574 aa  131  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.87 
 
 
1075 aa  131  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  22.93 
 
 
1145 aa  129  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  24.7 
 
 
1181 aa  129  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.38 
 
 
721 aa  126  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  39.66 
 
 
574 aa  125  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  22.97 
 
 
1132 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  23.05 
 
 
1148 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  39.33 
 
 
578 aa  124  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  22.9 
 
 
1172 aa  122  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  22.84 
 
 
1130 aa  121  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  22.81 
 
 
1165 aa  120  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  37.99 
 
 
616 aa  119  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.1 
 
 
605 aa  119  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.84 
 
 
565 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.86 
 
 
595 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.57 
 
 
1165 aa  117  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  21.98 
 
 
1175 aa  116  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  22.27 
 
 
1171 aa  116  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  22.57 
 
 
1172 aa  115  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  23.86 
 
 
1159 aa  115  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  35.55 
 
 
590 aa  115  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  34.07 
 
 
601 aa  114  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  22.26 
 
 
1225 aa  113  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  22.71 
 
 
1122 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  22.57 
 
 
1156 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  22.46 
 
 
1240 aa  112  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  22.51 
 
 
1155 aa  112  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.24 
 
 
631 aa  112  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  41.18 
 
 
613 aa  111  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  35.75 
 
 
584 aa  111  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.07 
 
 
584 aa  111  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.77 
 
 
1139 aa  111  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  21.57 
 
 
1157 aa  110  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  22.56 
 
 
1145 aa  110  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  36.31 
 
 
570 aa  110  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  36.69 
 
 
551 aa  110  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.12 
 
 
921 aa  110  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  22.91 
 
 
1167 aa  109  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  36.9 
 
 
584 aa  110  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  21.41 
 
 
1171 aa  109  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  22.37 
 
 
1176 aa  109  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  23.09 
 
 
1172 aa  108  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>