More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0996 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  53.39 
 
 		 1447 aa  1524    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  59.25 
 
 		 1407 aa  1663    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  44.39 
 
 		 1443 aa  1249    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  49.35 
 
 		 1436 aa  1271    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  42.4 
 
 		 970 aa  737    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  46.69 
 
 		 1468 aa  1141    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  48.18 
 
 		 1433 aa  1330    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1442 aa  2967    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  46.42 
 
 		 1365 aa  1135    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  48.18 
 
 		 1433 aa  1330    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  38.67 
 
 		 1493 aa  978    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  49.69 
 
 		 1435 aa  1390    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  48.18 
 
 		 1433 aa  1330    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  48.94 
 
 		 1388 aa  1139    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  46.84 
 
 		 1438 aa  1277    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  56.81 
 
 		 1210 aa  1041    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  56.96 
 
 		 1426 aa  1533    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  48.18 
 
 		 1433 aa  1330    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  54.84 
 
 		 1527 aa  1390    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  48.79 
 
 		 1433 aa  1328    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  43 
 
 		 1479 aa  1008    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  62.27 
 
 		 1214 aa  1117    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  45.37 
 
 		 1421 aa  1207    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  48.18 
 
 		 1433 aa  1335    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  66.69 
 
 		 1433 aa  2010    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  48.15 
 
 		 1433 aa  1337    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  48.14 
 
 		 1433 aa  1329    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  50.33 
 
 		 1367 aa  1191    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  53.08 
 
 		 1440 aa  1410    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  39.76 
 
 		 1438 aa  863    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  52.52 
 
 		 1397 aa  1457    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  46.53 
 
 		 1465 aa  1083    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  55.13 
 
 		 1402 aa  1524    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  46.6 
 
 		 1390 aa  1088    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  56.99 
 
 		 1449 aa  1608    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  57.13 
 
 		 1449 aa  1611    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  48.21 
 
 		 1433 aa  1330    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  38.14 
 
 		 1442 aa  846    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  60.24 
 
 		 1212 aa  1073    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  46.96 
 
 		 1635 aa  1137    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  41.17 
 
 		 1437 aa  1101    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  43.51 
 
 		 1432 aa  1202    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  42.54 
 
 		 1437 aa  1171    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  46.67 
 
 		 1464 aa  1127    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  46.84 
 
 		 1438 aa  1277    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  49.26 
 
 		 1444 aa  1384    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  48.12 
 
 		 1362 aa  1103    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  50 
 
 		 1367 aa  1186    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  48.18 
 
 		 1433 aa  1330    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  40.18 
 
 		 989 aa  610  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  60.72 
 
 		 483 aa  596  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  25.25 
 
 		 1127 aa  207  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  25.97 
 
 		 1145 aa  194  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  24.67 
 
 		 1151 aa  182  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1148 aa  178  6e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  24.51 
 
 		 1157 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  24.4 
 
 		 1155 aa  177  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  24.18 
 
 		 1130 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  25.57 
 
 		 1181 aa  176  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  24.92 
 
 		 1180 aa  176  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  24.02 
 
 		 1156 aa  175  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  24.56 
 
 		 1176 aa  173  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  23.02 
 
 		 1184 aa  171  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  24.63 
 
 		 1145 aa  171  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  22.55 
 
 		 1156 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.74 
 
 		 1139 aa  166  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  24.01 
 
 		 1178 aa  164  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  27.12 
 
 		 1607 aa  164  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.31 
 
 		 1122 aa  164  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  23.89 
 
 		 1149 aa  164  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  24.18 
 
 		 1148 aa  162  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  22.69 
 
 		 1132 aa  162  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  42.36 
 
 		 584 aa  162  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  24.21 
 
 		 1165 aa  162  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  23.41 
 
 		 1240 aa  160  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  43.78 
 
 		 551 aa  160  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  23.98 
 
 		 1179 aa  160  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1296  DNA polymerase III, alpha subunit  22.93 
 
 		 1181 aa  158  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  23.98 
 
 		 1167 aa  158  8e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  24.38 
 
 		 1186 aa  156  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.4 
 
 		 1134 aa  156  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  23.05 
 
 		 1160 aa  155  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3857  DNA polymerase III, alpha subunit  23.4 
 
 		 1296 aa  155  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  23.32 
 
 		 1214 aa  155  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  22.76 
 
 		 1155 aa  155  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  24.17 
 
 		 1155 aa  154  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  22.76 
 
 		 1159 aa  154  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.5 
 
 		 1165 aa  153  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  25.14 
 
 		 1260 aa  154  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  23 
 
 		 1225 aa  153  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  24.3 
 
 		 1279 aa  152  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  23.6 
 
 		 1075 aa  152  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  24.94 
 
 		 1139 aa  152  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.32 
 
 		 595 aa  152  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  50.69 
 
 		 560 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  24.73 
 
 		 1272 aa  150  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  22.5 
 
 		 1164 aa  150  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  24.76 
 
 		 1190 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  23.71 
 
 		 1173 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  41.27 
 
 		 570 aa  147  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>