More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1818 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 180 aa  361  3e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  43.1 
 
 		 1442 aa  141  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.18 
 
 		 695 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  42.86 
 
 		 570 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  41.44 
 
 		 707 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.91 
 
 		 479 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  42.05 
 
 		 695 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.48 
 
 		 695 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  37.5 
 
 		 1407 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  42.54 
 
 		 578 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.46 
 
 		 769 aa  121  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  44.57 
 
 		 719 aa  120  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  39.23 
 
 		 485 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.11 
 
 		 659 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.78 
 
 		 731 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  39.78 
 
 		 714 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  40.76 
 
 		 645 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  40.88 
 
 		 551 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  42.37 
 
 		 729 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  35.96 
 
 		 1367 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  35.96 
 
 		 1367 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  44.13 
 
 		 590 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.95 
 
 		 463 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.04 
 
 		 706 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.99 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.46 
 
 		 722 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.23 
 
 		 719 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  36.31 
 
 		 1433 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.81 
 
 		 721 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  35.75 
 
 		 1449 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  35.75 
 
 		 1449 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.08 
 
 		 565 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.6 
 
 		 462 aa  111  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  36.11 
 
 		 1402 aa  111  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.57 
 
 		 952 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  42.86 
 
 		 630 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  42.86 
 
 		 617 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  36.63 
 
 		 1390 aa  109  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  42.31 
 
 		 584 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  41.85 
 
 		 574 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  40 
 
 		 616 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  41.85 
 
 		 630 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  41.85 
 
 		 630 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  40.56 
 
 		 613 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  41.94 
 
 		 584 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  40.98 
 
 		 603 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 		 502 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.71 
 
 		 921 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.78 
 
 		 595 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  31.21 
 
 		 1433 aa  104  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.27 
 
 		 729 aa  104  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  39.01 
 
 		 601 aa  103  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.91 
 
 		 238 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.7 
 
 		 378 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  37.91 
 
 		 616 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.03 
 
 		 930 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.36 
 
 		 398 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  34.68 
 
 		 1397 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  36.21 
 
 		 1365 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  32.76 
 
 		 1426 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  32.77 
 
 		 1436 aa  102  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.25 
 
 		 610 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.56 
 
 		 609 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  32.77 
 
 		 1438 aa  101  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  32.77 
 
 		 1438 aa  101  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  40.76 
 
 		 574 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.24 
 
 		 383 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  37.36 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  31.58 
 
 		 1435 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  38.76 
 
 		 578 aa  100  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  35.2 
 
 		 1465 aa  100  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  33.53 
 
 		 1421 aa  100  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  40.36 
 
 		 379 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.24 
 
 		 395 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.18 
 
 		 481 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.28 
 
 		 482 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  34.46 
 
 		 1527 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  30.06 
 
 		 970 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  30.41 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  30.41 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  30.41 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  30.41 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  30.41 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  30.41 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.53 
 
 		 375 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.53 
 
 		 375 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  30.41 
 
 		 1433 aa  99  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  30.41 
 
 		 1433 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.53 
 
 		 375 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  39.01 
 
 		 566 aa  99  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.95 
 
 		 375 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  29.82 
 
 		 1433 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0088  DNA polymerase III subunit alpha  37.08 
 
 		 235 aa  99  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  32.16 
 
 		 1444 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.95 
 
 		 375 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 235 aa  98.2  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  33.52 
 
 		 1447 aa  98.2  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1033  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 		 238 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  36.05 
 
 		 222 aa  97.8  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.99 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>