More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1965 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  48.36 
 
 		 1390 aa  1104    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  55.76 
 
 		 1444 aa  1432    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  44.03 
 
 		 1365 aa  1056    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  48.99 
 
 		 1367 aa  1182    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  45.44 
 
 		 1436 aa  1268    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  50.32 
 
 		 1527 aa  1251    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  44.51 
 
 		 970 aa  773    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  52.12 
 
 		 1440 aa  1400    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  46.05 
 
 		 1468 aa  1129    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  38.94 
 
 		 1438 aa  857    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  50.28 
 
 		 1433 aa  1383    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  50.28 
 
 		 1433 aa  1384    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  41.06 
 
 		 1493 aa  988    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  54.16 
 
 		 1433 aa  1378    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  50.28 
 
 		 1433 aa  1383    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  46.77 
 
 		 1388 aa  1115    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  49.63 
 
 		 1421 aa  1189    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  47.49 
 
 		 1362 aa  1089    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  50.49 
 
 		 1433 aa  1385    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  50.28 
 
 		 1433 aa  1383    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  52.55 
 
 		 1402 aa  1377    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  41.93 
 
 		 1479 aa  1010    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  66.1 
 
 		 1214 aa  1183    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  51.3 
 
 		 1433 aa  1396    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  50.28 
 
 		 1433 aa  1383    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  49.72 
 
 		 1443 aa  1239    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  46.84 
 
 		 1438 aa  1289    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  48.83 
 
 		 1367 aa  1176    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  56.72 
 
 		 1407 aa  1546    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  50.28 
 
 		 1433 aa  1380    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  52.76 
 
 		 1397 aa  1470    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  54.69 
 
 		 1449 aa  1496    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  54.84 
 
 		 1449 aa  1496    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  50.07 
 
 		 1433 aa  1377    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  58.41 
 
 		 1212 aa  1059    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  46.07 
 
 		 1635 aa  1121    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  44.51 
 
 		 1437 aa  1050    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  48.48 
 
 		 1432 aa  1186    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  46.69 
 
 		 1437 aa  1112    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  46.69 
 
 		 1464 aa  1149    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  46.84 
 
 		 1438 aa  1289    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  44.9 
 
 		 1465 aa  1035    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  50.95 
 
 		 1447 aa  1321    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  55.81 
 
 		 1433 aa  1524    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1426 aa  2955    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  38.57 
 
 		 1442 aa  886    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  59.69 
 
 		 1210 aa  1061    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  56.96 
 
 		 1442 aa  1533    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  56.49 
 
 		 1435 aa  1448    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  61.36 
 
 		 483 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  38.07 
 
 		 989 aa  596  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.28 
 
 		 1075 aa  179  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  22.77 
 
 		 1156 aa  179  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  24.73 
 
 		 1165 aa  178  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  24.29 
 
 		 1157 aa  178  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  23.43 
 
 		 1127 aa  175  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1148 aa  174  9e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  24.65 
 
 		 1155 aa  173  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  24.43 
 
 		 1156 aa  172  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  24.17 
 
 		 1139 aa  172  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  24.94 
 
 		 1228 aa  171  9e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  23.46 
 
 		 1176 aa  171  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  23.7 
 
 		 1145 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  24.24 
 
 		 1167 aa  166  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  24.15 
 
 		 1130 aa  164  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  23.37 
 
 		 1145 aa  162  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  22.68 
 
 		 1178 aa  159  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  24.41 
 
 		 1173 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1296  DNA polymerase III, alpha subunit  22.37 
 
 		 1181 aa  159  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  24.39 
 
 		 1173 aa  158  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  22.53 
 
 		 1172 aa  158  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  24.3 
 
 		 1185 aa  158  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  23.71 
 
 		 1155 aa  157  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  22.26 
 
 		 1132 aa  157  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  22.98 
 
 		 1165 aa  157  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  23.24 
 
 		 1155 aa  156  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.18 
 
 		 1170 aa  156  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  24.38 
 
 		 1165 aa  157  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  22.82 
 
 		 1172 aa  156  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  22.79 
 
 		 1181 aa  157  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  22.96 
 
 		 1184 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  23.34 
 
 		 1165 aa  155  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.09 
 
 		 1182 aa  155  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  24.06 
 
 		 1174 aa  154  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  24.28 
 
 		 1174 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  23.29 
 
 		 1148 aa  154  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  22.75 
 
 		 1164 aa  154  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  24.43 
 
 		 1158 aa  154  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  22.42 
 
 		 1240 aa  153  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1496  DNA polymerase III subunit alpha  23.99 
 
 		 1157 aa  154  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  23.84 
 
 		 1157 aa  154  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  23.03 
 
 		 1180 aa  153  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  22.95 
 
 		 1151 aa  152  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  23.6 
 
 		 1173 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  23.57 
 
 		 1173 aa  153  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  24.17 
 
 		 1174 aa  153  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  23.74 
 
 		 1153 aa  152  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  23.88 
 
 		 1157 aa  152  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  22.82 
 
 		 1122 aa  152  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  23.5 
 
 		 1172 aa  152  6e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>