More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1004 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1004  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 282 aa  578  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0978  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.93 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0235504  normal  0.0652516 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  39.29 
 
 		 1440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  40.5 
 
 		 601 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.6 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  36.56 
 
 		 574 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.51 
 
 		 584 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  36.73 
 
 		 707 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  38.1 
 
 		 617 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  39.15 
 
 		 566 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  40.11 
 
 		 560 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  37.19 
 
 		 578 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  35.42 
 
 		 584 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  38.2 
 
 		 921 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  34.24 
 
 		 1367 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  36.17 
 
 		 578 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  34.24 
 
 		 1367 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  36.36 
 
 		 574 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  36.82 
 
 		 603 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  34.9 
 
 		 244 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000436585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.57 
 
 		 595 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  36.24 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  38.07 
 
 		 1407 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  34.81 
 
 		 1433 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  35.23 
 
 		 1447 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.87 
 
 		 610 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  36.24 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1607  DNA polymerase III subunit epsilon  32.64 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  35.16 
 
 		 1433 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  35.71 
 
 		 551 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  38.93 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.5 
 
 		 595 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  37.58 
 
 		 240 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  36.11 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  37.58 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.23 
 
 		 605 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.96 
 
 		 719 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  34.76 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  34.69 
 
 		 570 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  33.5 
 
 		 613 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  36.56 
 
 		 630 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  33.15 
 
 		 1436 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  33.15 
 
 		 970 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  33.73 
 
 		 1433 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  33.73 
 
 		 1433 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  34.66 
 
 		 1442 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  34.9 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  33.73 
 
 		 1433 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  33.73 
 
 		 1433 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  35.29 
 
 		 1421 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  36.56 
 
 		 630 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  33.15 
 
 		 1433 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  36.56 
 
 		 630 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  36.13 
 
 		 729 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  33.15 
 
 		 1433 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  36.9 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  33.15 
 
 		 1433 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  33.73 
 
 		 1433 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  37.97 
 
 		 584 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  32.6 
 
 		 1433 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  35.52 
 
 		 645 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  34.22 
 
 		 242 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.98 
 
 		 609 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  35.6 
 
 		 485 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.24 
 
 		 236 aa  99  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  35.71 
 
 		 1444 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  34.9 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  36.73 
 
 		 590 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.79 
 
 		 631 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.29 
 
 		 706 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  32.97 
 
 		 1438 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  33.52 
 
 		 1435 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  32.97 
 
 		 1438 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1384  Rad3-related DNA helicase  35.83 
 
 		 797 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  32.73 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  32.73 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  32.73 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  32.73 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  32.73 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.65 
 
 		 731 aa  96.3  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  37.17 
 
 		 616 aa  96.3  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.39 
 
 		 934 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  33.13 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0839  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.04 
 
 		 236 aa  95.9  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  33.12 
 
 		 315 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.39 
 
 		 934 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.39 
 
 		 934 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 240 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  34.23 
 
 		 240 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>