More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1813 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  100 
 
 		 603 aa  1183    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  61.78 
 
 		 574 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  77.74 
 
 		 584 aa  806    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  62.02 
 
 		 574 aa  640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  60.04 
 
 		 605 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  60 
 
 		 609 aa  594  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  59.53 
 
 		 601 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  58.44 
 
 		 585 aa  566  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  55.35 
 
 		 566 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  58.63 
 
 		 607 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.94 
 
 		 631 aa  537  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  56.23 
 
 		 578 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.1 
 
 		 595 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  54.4 
 
 		 570 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.65 
 
 		 584 aa  519  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  56.47 
 
 		 613 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  55.44 
 
 		 590 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  54.84 
 
 		 584 aa  514  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  53.09 
 
 		 578 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  52.53 
 
 		 601 aa  501  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  50.96 
 
 		 616 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  54.1 
 
 		 590 aa  480  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  52.79 
 
 		 630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  52.52 
 
 		 630 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  52.52 
 
 		 630 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  52.66 
 
 		 617 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.57 
 
 		 610 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  48.22 
 
 		 645 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.23 
 
 		 595 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  45.99 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  41.31 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.71 
 
 		 565 aa  187  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.51 
 
 		 476 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.67 
 
 		 475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.19 
 
 		 463 aa  153  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.72 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.7 
 
 		 398 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.02 
 
 		 462 aa  150  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  33.08 
 
 		 1390 aa  148  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  40 
 
 		 1397 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.41 
 
 		 378 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.79 
 
 		 481 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  27.82 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  38.05 
 
 		 1447 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  36.77 
 
 		 1407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.62 
 
 		 449 aa  140  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.46 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  38 
 
 		 379 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  40.88 
 
 		 1433 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.02 
 
 		 375 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.02 
 
 		 375 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.02 
 
 		 375 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.02 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.43 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  30.81 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.86 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.71 
 
 		 383 aa  135  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  40.96 
 
 		 1442 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.25 
 
 		 456 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  39.78 
 
 		 1402 aa  133  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0827  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.29 
 
 		 470 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  40.96 
 
 		 1362 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  37.32 
 
 		 660 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.64 
 
 		 375 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.64 
 
 		 375 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  36.87 
 
 		 1465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.01 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 453 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3006  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  39.46 
 
 		 381 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00547496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3040  DNA polymerase/helicase  39.46 
 
 		 381 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  33.46 
 
 		 657 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2940  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  39.13 
 
 		 381 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  32.78 
 
 		 1527 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  28.74 
 
 		 641 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  29.85 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  25 
 
 		 593 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.97 
 
 		 205 aa  126  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  28.47 
 
 		 631 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  33.94 
 
 		 1449 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 		 614 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 665 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  33.94 
 
 		 1449 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  33.21 
 
 		 654 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  30 
 
 		 652 aa  123  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  37.5 
 
 		 1367 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  37.5 
 
 		 1367 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  32.58 
 
 		 663 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  30.07 
 
 		 628 aa  121  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  32.59 
 
 		 681 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  32.59 
 
 		 681 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  26.92 
 
 		 607 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  35.94 
 
 		 1388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  31.85 
 
 		 674 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  36.89 
 
 		 1440 aa  120  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.05 
 
 		 260 aa  120  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  31.56 
 
 		 653 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  35.35 
 
 		 1433 aa  120  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.35 
 
 		 466 aa  120  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  28.71 
 
 		 614 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1739  excinuclease ABC subunit C  31.82 
 
 		 742 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00965022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>