More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_4015 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 
482 aa  944    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.05 
 
 
462 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.35 
 
 
463 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.43 
 
 
476 aa  335  9e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.3 
 
 
453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0827  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.86 
 
 
470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.261841  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.38 
 
 
502 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.69 
 
 
481 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.36 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.57 
 
 
530 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  39.22 
 
 
530 aa  303  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.16 
 
 
375 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.16 
 
 
375 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.16 
 
 
375 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  44.48 
 
 
379 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.64 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.1 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.64 
 
 
392 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.74 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.62 
 
 
383 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.98 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.74 
 
 
378 aa  217  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3040  DNA polymerase/helicase  43.77 
 
 
381 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3006  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  43.77 
 
 
381 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00547496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2940  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  43.77 
 
 
381 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.14 
 
 
456 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.79 
 
 
456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  27.91 
 
 
457 aa  180  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.94 
 
 
453 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  33.59 
 
 
570 aa  163  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.09 
 
 
449 aa  160  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.9 
 
 
565 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.29 
 
 
459 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.07 
 
 
595 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  32.23 
 
 
566 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  32.32 
 
 
590 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  32.13 
 
 
603 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  30.05 
 
 
574 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  32.79 
 
 
617 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1703  nucleotide excision repair endonuclease  34.31 
 
 
292 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.53 
 
 
584 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.99 
 
 
595 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  32.11 
 
 
584 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.55 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  34.71 
 
 
630 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  31.9 
 
 
585 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  33.94 
 
 
578 aa  136  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  32.11 
 
 
574 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  34.36 
 
 
630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  34.36 
 
 
630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.45 
 
 
610 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  36.18 
 
 
578 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  33.15 
 
 
560 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.15 
 
 
631 aa  133  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.01 
 
 
605 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  33.33 
 
 
613 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.78 
 
 
609 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2036  nucleotide excision repair endonuclease  31.7 
 
 
293 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.362279  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1863  nucleotide excision repair endonuclease  31.7 
 
 
293 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  41.38 
 
 
720 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1437  nucleotide excision repair endonuclease  31.32 
 
 
293 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1422  nucleotide excision repair endonuclease  31.32 
 
 
293 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28855  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.82 
 
 
769 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  30.75 
 
 
601 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1405  nucleotide excision repair endonuclease  31.32 
 
 
293 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  30.42 
 
 
616 aa  123  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.59 
 
 
475 aa  123  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  32.01 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  31.82 
 
 
607 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2460  nucleotide excision repair endonuclease  32.46 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.41654  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  35 
 
 
590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 
715 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1963  nucleotide excision repair endonuclease  32.46 
 
 
295 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  33.1 
 
 
584 aa  121  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1986  nucleotide excision repair endonuclease  32.46 
 
 
295 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.282045  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01710  endonuclease of nucleotide excision repair  32.46 
 
 
295 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1901  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.46 
 
 
295 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.195835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1891  nucleotide excision repair endonuclease  32.46 
 
 
295 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01698  hypothetical protein  32.46 
 
 
295 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1823  nucleotide excision repair endonuclease  32.46 
 
 
295 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.21 
 
 
921 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  37.25 
 
 
1433 aa  120  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  32.11 
 
 
645 aa  120  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.57 
 
 
180 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.57 
 
 
659 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5151  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.61 
 
 
174 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.822  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1449  nucleotide excision repair endonuclease  31.72 
 
 
295 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.432222 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  40.4 
 
 
791 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4261  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
275 aa  116  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  30.26 
 
 
601 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  44.67 
 
 
695 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  34.88 
 
 
1397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  34.16 
 
 
1442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.67 
 
 
695 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.33 
 
 
695 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.84 
 
 
934 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.84 
 
 
934 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.84 
 
 
934 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29310  nucleotide excision repair endonuclease  34.86 
 
 
282 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.525257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.67 
 
 
934 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>