More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1553 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 462 aa  958    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  58.02 
 
 		 463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.73 
 
 		 476 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0827  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.24 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.58 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.51 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.05 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.2 
 
 		 502 aa  382  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.05 
 
 		 530 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  42.33 
 
 		 530 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.05 
 
 		 482 aa  353  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.91 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.55 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.59 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.03 
 
 		 392 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.76 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.49 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.49 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  41.3 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.03 
 
 		 375 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.03 
 
 		 375 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.03 
 
 		 375 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.28 
 
 		 453 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3040  DNA polymerase/helicase  40.22 
 
 		 381 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3006  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  40.22 
 
 		 381 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00547496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2940  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  40.22 
 
 		 381 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  30.05 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1422  nucleotide excision repair endonuclease  40.51 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1437  nucleotide excision repair endonuclease  40.29 
 
 		 293 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1405  nucleotide excision repair endonuclease  40.29 
 
 		 293 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2036  nucleotide excision repair endonuclease  40.15 
 
 		 293 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.362279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1863  nucleotide excision repair endonuclease  40.15 
 
 		 293 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2460  nucleotide excision repair endonuclease  39.56 
 
 		 295 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.41654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.22 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1963  nucleotide excision repair endonuclease  39.93 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01710  endonuclease of nucleotide excision repair  39.56 
 
 		 295 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1901  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.56 
 
 		 295 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.195835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01698  hypothetical protein  39.56 
 
 		 295 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1823  nucleotide excision repair endonuclease  39.56 
 
 		 295 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1986  nucleotide excision repair endonuclease  39.93 
 
 		 295 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.282045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1891  nucleotide excision repair endonuclease  39.56 
 
 		 295 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.46 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1703  nucleotide excision repair endonuclease  40.36 
 
 		 292 aa  190  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.55 
 
 		 565 aa  189  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1449  nucleotide excision repair endonuclease  38.83 
 
 		 295 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.432222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4261  excinuclease ABC subunit C  38.97 
 
 		 275 aa  183  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.66 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  35.16 
 
 		 590 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.5 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  35 
 
 		 578 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  32.64 
 
 		 613 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.82 
 
 		 610 aa  164  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  30.08 
 
 		 570 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  31.94 
 
 		 566 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29310  nucleotide excision repair endonuclease  39.78 
 
 		 282 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.525257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.66 
 
 		 595 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.17 
 
 		 595 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  32.18 
 
 		 616 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  31.82 
 
 		 617 aa  156  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  33.15 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  32.53 
 
 		 645 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.76 
 
 		 584 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  30.48 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  31.72 
 
 		 630 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  31.72 
 
 		 630 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  31.72 
 
 		 630 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.47 
 
 		 631 aa  151  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.76 
 
 		 609 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.91 
 
 		 715 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.12 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  34.04 
 
 		 603 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  31.91 
 
 		 574 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  30.89 
 
 		 585 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  30.75 
 
 		 601 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  44.3 
 
 		 720 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  33.88 
 
 		 590 aa  142  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  34.28 
 
 		 551 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  32.24 
 
 		 578 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.61 
 
 		 605 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  30.79 
 
 		 584 aa  140  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5151  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.33 
 
 		 174 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.46 
 
 		 769 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  31.25 
 
 		 584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  30.39 
 
 		 601 aa  134  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  30.79 
 
 		 607 aa  126  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  41.51 
 
 		 1433 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.89 
 
 		 180 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.56 
 
 		 204 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  37.18 
 
 		 1442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  35.9 
 
 		 1407 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  38.33 
 
 		 1426 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  35.84 
 
 		 1447 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  41.56 
 
 		 222 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 203 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.41 
 
 		 203 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.34 
 
 		 475 aa  112  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.6 
 
 		 180 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1834  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.36 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.600995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1381  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.04 
 
 		 204 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348365  normal  0.0969598 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0222  exonuclease  39.62 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>