More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0968 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  61.68 
 
 		 605 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1127    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  59.12 
 
 		 574 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  58.21 
 
 		 574 aa  601  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  55.24 
 
 		 601 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.19 
 
 		 609 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  56.51 
 
 		 584 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  55.35 
 
 		 603 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.77 
 
 		 584 aa  556  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  56.17 
 
 		 585 aa  554  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  57.2 
 
 		 607 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  55.02 
 
 		 590 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.16 
 
 		 631 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  52.92 
 
 		 601 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  51.43 
 
 		 578 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.74 
 
 		 595 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  51.92 
 
 		 570 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  52.38 
 
 		 578 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  49.91 
 
 		 616 aa  498  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  52.44 
 
 		 584 aa  488  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  53.45 
 
 		 613 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  54.51 
 
 		 590 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  50.9 
 
 		 630 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  50.72 
 
 		 630 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  50.72 
 
 		 630 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  50.37 
 
 		 617 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.53 
 
 		 610 aa  448  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  48.46 
 
 		 645 aa  428  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.49 
 
 		 595 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  42.96 
 
 		 551 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  42.29 
 
 		 560 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.67 
 
 		 565 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.43 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.23 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  32 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  28.53 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.94 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 614 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.28 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  30.14 
 
 		 607 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.25 
 
 		 453 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.31 
 
 		 453 aa  153  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.59 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.34 
 
 		 459 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.46 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  30 
 
 		 593 aa  150  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  35.69 
 
 		 613 aa  148  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  39.09 
 
 		 1397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 		 631 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.97 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  29.41 
 
 		 628 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  30.46 
 
 		 625 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  28.99 
 
 		 594 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  28.99 
 
 		 594 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  33.58 
 
 		 636 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  32.02 
 
 		 574 aa  145  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  31.64 
 
 		 619 aa  144  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  28.7 
 
 		 594 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  28.7 
 
 		 594 aa  143  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  28.7 
 
 		 594 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  28.7 
 
 		 594 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  28.7 
 
 		 594 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  30.88 
 
 		 628 aa  143  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  29.48 
 
 		 641 aa  143  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  30.33 
 
 		 629 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  30.09 
 
 		 591 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  37.44 
 
 		 1407 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  30.25 
 
 		 596 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  29.13 
 
 		 652 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  32.1 
 
 		 624 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  31.12 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  35.21 
 
 		 614 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  28.12 
 
 		 594 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  28.41 
 
 		 594 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  34.07 
 
 		 612 aa  140  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  33.09 
 
 		 604 aa  140  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 		 613 aa  140  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  35.56 
 
 		 615 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  35.95 
 
 		 681 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 684 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  35.95 
 
 		 681 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 684 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.6 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.01 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  35.95 
 
 		 674 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  28.53 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  37.73 
 
 		 1447 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  39.22 
 
 		 1433 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  27.24 
 
 		 607 aa  139  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  28.92 
 
 		 607 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  28.12 
 
 		 594 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  27.19 
 
 		 604 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 682 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 677 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  36.28 
 
 		 740 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.71 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  30.33 
 
 		 599 aa  137  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2884  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 		 749 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2319  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.08 
 
 		 376 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2829  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 		 747 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>