More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3141 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 595 aa  1179    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.11 
 
 		 605 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  56.64 
 
 		 590 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  52.12 
 
 		 574 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.86 
 
 		 584 aa  531  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  53.1 
 
 		 603 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  52.63 
 
 		 574 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  50.95 
 
 		 601 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.29 
 
 		 631 aa  519  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  53.18 
 
 		 584 aa  513  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  52.92 
 
 		 584 aa  511  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  49.74 
 
 		 566 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  51.74 
 
 		 590 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  47.82 
 
 		 585 aa  487  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.91 
 
 		 609 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  49.83 
 
 		 607 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  48.61 
 
 		 601 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  48.79 
 
 		 616 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  48.77 
 
 		 570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  48.12 
 
 		 578 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  49.56 
 
 		 578 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  48.51 
 
 		 613 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.66 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  44.31 
 
 		 630 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  43.34 
 
 		 617 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  44.14 
 
 		 630 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  44.14 
 
 		 630 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  43.67 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.47 
 
 		 595 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  41.47 
 
 		 645 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  44.29 
 
 		 560 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.53 
 
 		 565 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.68 
 
 		 475 aa  187  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  42.86 
 
 		 1397 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  38.1 
 
 		 1407 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.17 
 
 		 462 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.91 
 
 		 481 aa  157  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.48 
 
 		 453 aa  157  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.65 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  33.56 
 
 		 619 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  27.45 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  36.32 
 
 		 1442 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.45 
 
 		 476 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  39.55 
 
 		 1435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  28.48 
 
 		 631 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.4 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 		 459 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.39 
 
 		 449 aa  148  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  39.78 
 
 		 1447 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  27.9 
 
 		 593 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.5 
 
 		 456 aa  146  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  37.68 
 
 		 1449 aa  146  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  40.32 
 
 		 1390 aa  146  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  40.48 
 
 		 1444 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  37.2 
 
 		 1449 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  34.08 
 
 		 613 aa  144  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  34.02 
 
 		 614 aa  144  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  37.06 
 
 		 1433 aa  143  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  27.62 
 
 		 641 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.99 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  32.92 
 
 		 530 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  31.72 
 
 		 604 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  36.84 
 
 		 1402 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.95 
 
 		 466 aa  140  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  36.71 
 
 		 1433 aa  140  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  34.66 
 
 		 649 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2319  Excinuclease ABC C subunit domain protein  28.81 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  36 
 
 		 1426 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.9 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 		 623 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.08 
 
 		 392 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.97 
 
 		 453 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  39.79 
 
 		 1365 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  27.4 
 
 		 594 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  27.4 
 
 		 594 aa  138  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  27.4 
 
 		 594 aa  138  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  27.4 
 
 		 594 aa  138  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  27.4 
 
 		 594 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  26.07 
 
 		 616 aa  137  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  25.22 
 
 		 625 aa  138  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  26.82 
 
 		 596 aa  137  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  28.34 
 
 		 599 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  26.14 
 
 		 628 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  27.4 
 
 		 594 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.88 
 
 		 398 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  27.4 
 
 		 594 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  28.53 
 
 		 628 aa  136  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  27.4 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  37.37 
 
 		 1433 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  35.75 
 
 		 970 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  26.84 
 
 		 594 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  37.37 
 
 		 1433 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  37.37 
 
 		 1433 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  37.37 
 
 		 1433 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  37.37 
 
 		 1433 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  36.87 
 
 		 1433 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  37.37 
 
 		 1433 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  36.87 
 
 		 1433 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 		 636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  25.62 
 
 		 615 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>