More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2470 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  55.93 
 
 		 1440 aa  1429    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  48.15 
 
 		 1442 aa  1337    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  58.72 
 
 		 1436 aa  1722    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  95.75 
 
 		 483 aa  957    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  92.46 
 
 		 970 aa  1879    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  54.05 
 
 		 1407 aa  1365    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  47.62 
 
 		 1362 aa  1075    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  50.54 
 
 		 1468 aa  1459    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  93.58 
 
 		 1433 aa  2830    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  52.65 
 
 		 1397 aa  1303    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  43.4 
 
 		 1465 aa  996    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  93.58 
 
 		 1433 aa  2830    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  93.51 
 
 		 1433 aa  2828    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  42.44 
 
 		 1493 aa  1037    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  93.58 
 
 		 1433 aa  2830    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1433 aa  2974    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  93.65 
 
 		 1433 aa  2829    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  93.44 
 
 		 1433 aa  2826    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  45.28 
 
 		 1388 aa  1048    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  58.85 
 
 		 1438 aa  1728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  53.45 
 
 		 1433 aa  1340    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  56.1 
 
 		 1210 aa  980    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  93.58 
 
 		 1433 aa  2830    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  71.32 
 
 		 1444 aa  2170    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  42.19 
 
 		 1479 aa  1067    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  55.13 
 
 		 1214 aa  972    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  51.3 
 
 		 1426 aa  1396    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  48.78 
 
 		 1367 aa  1141    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  37.2 
 
 		 1438 aa  915    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  48.88 
 
 		 1527 aa  1169    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  48.53 
 
 		 1367 aa  1134    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  73.71 
 
 		 1435 aa  2234    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  48.92 
 
 		 1447 aa  1206    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  50.8 
 
 		 1449 aa  1383    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  50.87 
 
 		 1449 aa  1384    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  44.03 
 
 		 1365 aa  1043    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  55.17 
 
 		 1212 aa  955    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  55.77 
 
 		 1635 aa  1418    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  45.9 
 
 		 1437 aa  1257    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  51.84 
 
 		 1432 aa  1481    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  48.9 
 
 		 1437 aa  1408    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  49.9 
 
 		 1464 aa  1466    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  40.1 
 
 		 1442 aa  915    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  54.37 
 
 		 1443 aa  1610    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  58.85 
 
 		 1438 aa  1728    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  47.44 
 
 		 1421 aa  1140    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  93.09 
 
 		 1433 aa  2812    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  48.18 
 
 		 1390 aa  1099    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  93.51 
 
 		 1433 aa  2816    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  52.76 
 
 		 1402 aa  1288    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  40.51 
 
 		 989 aa  620  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  25.03 
 
 		 1170 aa  172  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  25.03 
 
 		 1170 aa  172  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  25.79 
 
 		 1167 aa  168  9e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1148 aa  167  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  24.11 
 
 		 1454 aa  166  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  23.4 
 
 		 1148 aa  167  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  24.34 
 
 		 1130 aa  166  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  25.22 
 
 		 1145 aa  165  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  24.32 
 
 		 1240 aa  165  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  24.27 
 
 		 1179 aa  162  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  23.74 
 
 		 1127 aa  162  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  24.6 
 
 		 1156 aa  160  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.7 
 
 		 1139 aa  161  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.82 
 
 		 1122 aa  158  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  24.23 
 
 		 1510 aa  157  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  24.84 
 
 		 1155 aa  157  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  23.83 
 
 		 1184 aa  157  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  25.59 
 
 		 1180 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  23.47 
 
 		 1181 aa  156  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  23.62 
 
 		 1225 aa  155  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  22.53 
 
 		 1156 aa  154  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  22.99 
 
 		 1132 aa  153  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  24.15 
 
 		 1157 aa  154  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  23.9 
 
 		 1165 aa  152  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  26.16 
 
 		 1170 aa  151  7e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  22.93 
 
 		 1176 aa  148  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  24.07 
 
 		 1165 aa  148  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  23.63 
 
 		 1155 aa  147  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  23.12 
 
 		 1139 aa  146  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  24.2 
 
 		 1155 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0956  DNA polymerase III subunit alpha  23.47 
 
 		 1160 aa  144  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.582605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  23.27 
 
 		 1145 aa  144  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  38.07 
 
 		 551 aa  144  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  22.48 
 
 		 1164 aa  143  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  24.05 
 
 		 1160 aa  142  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3345  DNA polymerase III subunit alpha  23.47 
 
 		 1160 aa  142  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  24.61 
 
 		 1156 aa  142  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  23.84 
 
 		 1160 aa  142  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  22.57 
 
 		 1075 aa  142  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  23.95 
 
 		 1160 aa  141  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  23.95 
 
 		 1160 aa  141  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  37.25 
 
 		 584 aa  141  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  23.37 
 
 		 1160 aa  141  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  23.37 
 
 		 1171 aa  141  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  23.84 
 
 		 1160 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  23.95 
 
 		 1160 aa  141  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  23.37 
 
 		 1171 aa  141  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.71 
 
 		 595 aa  140  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  24.96 
 
 		 1476 aa  140  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>