More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf732 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  36.89 
 
 		 1465 aa  773    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  36.8 
 
 		 1433 aa  912    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  37.2 
 
 		 1433 aa  915    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  36.57 
 
 		 1443 aa  917    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  37.55 
 
 		 1436 aa  910    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1438 aa  2953    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  37.22 
 
 		 1468 aa  881    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  41.94 
 
 		 1210 aa  654    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  36.8 
 
 		 1433 aa  912    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  37.83 
 
 		 1527 aa  798    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  36.8 
 
 		 1433 aa  912    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  41.65 
 
 		 1493 aa  999    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  36.8 
 
 		 1433 aa  912    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  36.6 
 
 		 1433 aa  907    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  36.6 
 
 		 1433 aa  905    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  36.14 
 
 		 1365 aa  765    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  36.8 
 
 		 1433 aa  912    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  38.37 
 
 		 1435 aa  947    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  39.4 
 
 		 1402 aa  844    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  38.68 
 
 		 1407 aa  864    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  36.8 
 
 		 1433 aa  912    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  40.12 
 
 		 1479 aa  973    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  42.91 
 
 		 1214 aa  707    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  38.94 
 
 		 1426 aa  857    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  38.34 
 
 		 1388 aa  826    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  39.02 
 
 		 1421 aa  795    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  39.78 
 
 		 1367 aa  853    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  39.64 
 
 		 1397 aa  852    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  39.69 
 
 		 1440 aa  897    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  39.37 
 
 		 1449 aa  867    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  39.53 
 
 		 1449 aa  872    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  37.66 
 
 		 1444 aa  933    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  40.09 
 
 		 1367 aa  859    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  37.42 
 
 		 1438 aa  894    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  42.19 
 
 		 1212 aa  679    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  40.7 
 
 		 1362 aa  798    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  37.11 
 
 		 1433 aa  910    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  39.72 
 
 		 1635 aa  853    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  38.6 
 
 		 1437 aa  786    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  38.01 
 
 		 1432 aa  933    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  38.16 
 
 		 1437 aa  857    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  37.15 
 
 		 1464 aa  888    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  37.42 
 
 		 1438 aa  894    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  42.03 
 
 		 1442 aa  927    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  38.81 
 
 		 1433 aa  873    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  40.22 
 
 		 1390 aa  830    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  38.26 
 
 		 1447 aa  797    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  39.76 
 
 		 1442 aa  863    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  37.97 
 
 		 989 aa  520  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  49.38 
 
 		 483 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  30.74 
 
 		 970 aa  447  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  22.5 
 
 		 1167 aa  134  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  22.28 
 
 		 1181 aa  127  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  22.11 
 
 		 1225 aa  125  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  22.07 
 
 		 1127 aa  122  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  22.24 
 
 		 1176 aa  120  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  22.92 
 
 		 1122 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  21.17 
 
 		 1139 aa  119  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1148 aa  119  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  21.76 
 
 		 1145 aa  119  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  22.91 
 
 		 1163 aa  119  5e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  22.83 
 
 		 1180 aa  119  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  22.52 
 
 		 1145 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  22.51 
 
 		 1122 aa  117  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  21.55 
 
 		 1240 aa  116  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  22.65 
 
 		 1159 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  21.39 
 
 		 1130 aa  115  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.07 
 
 		 1165 aa  115  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  20.75 
 
 		 1184 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2925  DNA polymerase III, alpha subunit  22.43 
 
 		 1173 aa  112  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.917555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  22.02 
 
 		 1174 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  22.41 
 
 		 1134 aa  111  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  21.73 
 
 		 1156 aa  110  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1161  DNA polymerase III subunit alpha  22.15 
 
 		 1174 aa  109  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0775975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  22.22 
 
 		 1174 aa  109  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  21.8 
 
 		 1139 aa  109  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  21.65 
 
 		 1075 aa  108  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  24.44 
 
 		 1607 aa  108  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  22.1 
 
 		 1174 aa  108  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1638  DNA polymerase III, alpha subunit  20.53 
 
 		 1189 aa  107  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  22.04 
 
 		 1485 aa  107  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  23.09 
 
 		 1454 aa  107  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  21.39 
 
 		 1151 aa  106  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  22.74 
 
 		 1143 aa  106  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  23.57 
 
 		 1476 aa  105  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.33 
 
 		 921 aa  104  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  22.58 
 
 		 1143 aa  103  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  21.41 
 
 		 1157 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  20.68 
 
 		 1179 aa  103  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3775  DNA polymerase III subunit alpha  20.72 
 
 		 1162 aa  102  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998036 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1114  DNA polymerase III subunit alpha  22.22 
 
 		 1188 aa  101  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  21.86 
 
 		 1174 aa  101  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  21.52 
 
 		 1148 aa  101  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  22.14 
 
 		 1155 aa  101  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  21.06 
 
 		 1159 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  23.71 
 
 		 1228 aa  100  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  21.63 
 
 		 1148 aa  100  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  21.09 
 
 		 1160 aa  100  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2893  DNA polymerase III, alpha subunit  22.78 
 
 		 1190 aa  100  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.580471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38840  DNA polymerase III subunit alpha  20.43 
 
 		 1176 aa  100  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>