More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_3559 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  73.08 
 
 
1435 aa  2217    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  36.8 
 
 
1438 aa  912    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  58.6 
 
 
1436 aa  1724    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  99.15 
 
 
483 aa  980    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  98.86 
 
 
970 aa  1987    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  99.93 
 
 
1433 aa  2975    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  50.34 
 
 
1468 aa  1464    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  98.95 
 
 
1433 aa  2952    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  55.99 
 
 
1210 aa  972    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  99.93 
 
 
1433 aa  2975    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  100 
 
 
1433 aa  2976    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  40.36 
 
 
1493 aa  1035    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  99.93 
 
 
1433 aa  2975    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  47.19 
 
 
1367 aa  1131    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  45.32 
 
 
1388 aa  1050    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  93.51 
 
 
1433 aa  2828    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  50.28 
 
 
1426 aa  1384    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  99.93 
 
 
1433 aa  2975    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  41.03 
 
 
1479 aa  1064    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  54.4 
 
 
1214 aa  960    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  59.07 
 
 
1438 aa  1733    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  53.03 
 
 
1407 aa  1342    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  47.62 
 
 
1362 aa  1076    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  98.19 
 
 
1433 aa  2934    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  54.03 
 
 
1443 aa  1612    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  47.98 
 
 
1390 aa  1088    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  54.28 
 
 
1440 aa  1415    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  96.65 
 
 
1433 aa  2897    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  50.44 
 
 
1449 aa  1373    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  50.44 
 
 
1449 aa  1372    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  51.94 
 
 
1402 aa  1272    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  52.24 
 
 
1397 aa  1293    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  59.07 
 
 
1438 aa  1733    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  54.93 
 
 
1212 aa  952    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  48.18 
 
 
1442 aa  1330    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  70.55 
 
 
1444 aa  2149    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  55.67 
 
 
1635 aa  1407    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  45.6 
 
 
1437 aa  1247    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  51.91 
 
 
1432 aa  1492    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  48.72 
 
 
1437 aa  1409    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  49.32 
 
 
1464 aa  1460    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  43.79 
 
 
1465 aa  999    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  39.94 
 
 
1442 aa  913    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  43.48 
 
 
1365 aa  1037    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  48.44 
 
 
1527 aa  1159    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  99.72 
 
 
1433 aa  2973    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  47.04 
 
 
1367 aa  1125    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  48.46 
 
 
1447 aa  1194    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  47.08 
 
 
1421 aa  1126    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  54.03 
 
 
1433 aa  1343    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  39.65 
 
 
989 aa  601  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  24.72 
 
 
1148 aa  173  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  24.21 
 
 
1240 aa  170  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  23.87 
 
 
1170 aa  167  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  23.3 
 
 
1148 aa  165  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  23.98 
 
 
1130 aa  164  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  24.64 
 
 
1167 aa  160  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  23.79 
 
 
1127 aa  157  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  23.48 
 
 
1181 aa  156  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  24.26 
 
 
1145 aa  157  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  23.4 
 
 
1132 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  24.45 
 
 
1165 aa  155  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  24.02 
 
 
1179 aa  155  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  24.38 
 
 
1156 aa  154  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  23.1 
 
 
1454 aa  154  8.999999999999999e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  26.16 
 
 
1170 aa  153  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  22.99 
 
 
1510 aa  152  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.26 
 
 
1139 aa  152  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  22.42 
 
 
1156 aa  151  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  24.33 
 
 
1155 aa  151  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  23.67 
 
 
1139 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.11 
 
 
1122 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  24.34 
 
 
1165 aa  150  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  25 
 
 
1180 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  23.38 
 
 
1225 aa  149  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  23.43 
 
 
1184 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  25.68 
 
 
1170 aa  146  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  23.46 
 
 
1157 aa  145  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  21.93 
 
 
1164 aa  145  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  22.96 
 
 
1176 aa  145  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  23.3 
 
 
1155 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  39.8 
 
 
551 aa  144  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  23.77 
 
 
1145 aa  143  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  39.29 
 
 
584 aa  142  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  23.63 
 
 
1155 aa  140  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  23.35 
 
 
1476 aa  139  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  25.52 
 
 
1607 aa  138  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  23.1 
 
 
1173 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  23.45 
 
 
1160 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.11 
 
 
584 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.88 
 
 
921 aa  137  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0374  DNA polymerase III, alpha subunit  23.18 
 
 
1174 aa  137  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  23.34 
 
 
1160 aa  136  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  23.34 
 
 
1160 aa  136  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  23.34 
 
 
1160 aa  136  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  23.24 
 
 
1160 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.37 
 
 
595 aa  136  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03222  DNA polymerase III subunit alpha  23.15 
 
 
1143 aa  135  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.46 
 
 
1134 aa  135  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  23.79 
 
 
1156 aa  135  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>