More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl288 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  40.7 
 
 		 1440 aa  970    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  40.05 
 
 		 1433 aa  1041    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  44.76 
 
 		 1435 aa  1120    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  41.95 
 
 		 1388 aa  909    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  41.13 
 
 		 1436 aa  1018    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  40.12 
 
 		 1433 aa  1041    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  41.43 
 
 		 1367 aa  937    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  42.39 
 
 		 1407 aa  978    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  41.85 
 
 		 1362 aa  921    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  37.71 
 
 		 1468 aa  979    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  41.67 
 
 		 1367 aa  940    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  40.36 
 
 		 1433 aa  1042    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  40.43 
 
 		 1433 aa  1045    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  100 
 
 		 1493 aa  3066    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  41.24 
 
 		 1444 aa  1112    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  40.36 
 
 		 1433 aa  1042    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  45.14 
 
 		 1442 aa  963    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  41.65 
 
 		 1438 aa  1007    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  40.49 
 
 		 1433 aa  1046    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  38.62 
 
 		 1465 aa  799    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  40.36 
 
 		 1433 aa  1042    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  43.35 
 
 		 1397 aa  997    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  40.36 
 
 		 1433 aa  1042    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  40.67 
 
 		 1433 aa  1046    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  43.03 
 
 		 1443 aa  1030    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  60.7 
 
 		 1479 aa  1821    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  46.71 
 
 		 1214 aa  819    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  42.14 
 
 		 1447 aa  938    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  43.4 
 
 		 1390 aa  947    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  37.91 
 
 		 1365 aa  817    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  44.68 
 
 		 1210 aa  753    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  40.82 
 
 		 1527 aa  889    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  42.51 
 
 		 1433 aa  1046    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  42.05 
 
 		 1449 aa  933    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  42.9 
 
 		 1433 aa  987    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  42.05 
 
 		 1449 aa  932    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  45.53 
 
 		 1212 aa  761    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  41.14 
 
 		 1426 aa  998    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  42.37 
 
 		 1635 aa  935    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  39.58 
 
 		 1437 aa  896    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  42.52 
 
 		 1432 aa  1041    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  37.4 
 
 		 1437 aa  949    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  38.47 
 
 		 1464 aa  978    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  38.74 
 
 		 1442 aa  981    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  39.81 
 
 		 1421 aa  880    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  43.85 
 
 		 1402 aa  987    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  42.28 
 
 		 1438 aa  1020    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  42.28 
 
 		 1438 aa  1020    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  34.99 
 
 		 970 aa  539  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  38.17 
 
 		 989 aa  521  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  52.07 
 
 		 483 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  22.59 
 
 		 1167 aa  165  5.0000000000000005e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  24.94 
 
 		 1180 aa  158  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  24.09 
 
 		 1127 aa  155  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  24.31 
 
 		 1454 aa  153  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  23.75 
 
 		 1225 aa  152  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  26.9 
 
 		 1607 aa  152  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  24.06 
 
 		 1145 aa  151  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  23.33 
 
 		 1485 aa  150  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  24.62 
 
 		 1228 aa  150  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  23.98 
 
 		 1075 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  24.67 
 
 		 1476 aa  145  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  23.98 
 
 		 1510 aa  146  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  23.7 
 
 		 1176 aa  145  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  23.75 
 
 		 1240 aa  145  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  24.03 
 
 		 1194 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  24.08 
 
 		 1181 aa  144  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  24.06 
 
 		 1145 aa  142  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.16 
 
 		 1165 aa  141  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  23.9 
 
 		 1214 aa  141  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  23.66 
 
 		 1170 aa  140  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  21.1 
 
 		 1132 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.46 
 
 		 1170 aa  139  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  24.02 
 
 		 1130 aa  139  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1148 aa  138  7.000000000000001e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.51 
 
 		 1139 aa  137  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0531  DNA polymerase III, alpha subunit  23.84 
 
 		 1205 aa  136  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  23.55 
 
 		 1170 aa  133  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  22.78 
 
 		 1179 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  23.74 
 
 		 1157 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  21.63 
 
 		 1184 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0045  DNA polymerase III, alpha subunit  22.61 
 
 		 1163 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0276181 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  23.6 
 
 		 1158 aa  129  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  23.62 
 
 		 1177 aa  128  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  23.69 
 
 		 1171 aa  128  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  23.69 
 
 		 1160 aa  128  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  21.92 
 
 		 1182 aa  127  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  23.69 
 
 		 1171 aa  127  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  23.66 
 
 		 1177 aa  127  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  21.85 
 
 		 1156 aa  127  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  23.11 
 
 		 1260 aa  126  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  23.73 
 
 		 1173 aa  125  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  21.9 
 
 		 1155 aa  125  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  23.63 
 
 		 1185 aa  125  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  23 
 
 		 1201 aa  125  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  22.07 
 
 		 1331 aa  124  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  23.39 
 
 		 1183 aa  124  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  22.16 
 
 		 1165 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.73 
 
 		 1165 aa  124  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1086  DNA polymerase III subunit alpha  24.13 
 
 		 1181 aa  123  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>