More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0983 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  39.87 
 
 
1365 aa  899    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  56.58 
 
 
1443 aa  1398    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  43.79 
 
 
1436 aa  1184    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  45.6 
 
 
1433 aa  1247    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  40.37 
 
 
970 aa  697    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  42.79 
 
 
1367 aa  934    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  48.11 
 
 
1468 aa  1155    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  45.67 
 
 
1433 aa  1249    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  45.6 
 
 
1433 aa  1247    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  39.58 
 
 
1493 aa  890    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  43.11 
 
 
1402 aa  1030    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  45.67 
 
 
1433 aa  1249    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  38.6 
 
 
1438 aa  786    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  39.65 
 
 
1442 aa  760    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  43.93 
 
 
1438 aa  1195    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  45.39 
 
 
1433 aa  1247    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  41.75 
 
 
1390 aa  897    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  45.67 
 
 
1433 aa  1249    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  37.43 
 
 
1447 aa  965    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  41.2 
 
 
1388 aa  906    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  41.5 
 
 
1479 aa  926    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  46.07 
 
 
1214 aa  805    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  44.83 
 
 
1397 aa  1052    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  45.67 
 
 
1433 aa  1249    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  43.93 
 
 
1438 aa  1195    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  42.67 
 
 
1362 aa  917    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  45.9 
 
 
1433 aa  1257    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  45.39 
 
 
1440 aa  1083    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  40.08 
 
 
1465 aa  858    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  45.72 
 
 
1433 aa  1247    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  44.88 
 
 
1433 aa  1090    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  45.76 
 
 
1449 aa  1094    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  45.84 
 
 
1449 aa  1096    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  45.76 
 
 
1210 aa  797    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  45.12 
 
 
1212 aa  770    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  47.94 
 
 
1635 aa  1153    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  100 
 
 
1437 aa  2963    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  45.53 
 
 
1433 aa  1247    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  48.46 
 
 
1432 aa  1303    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  51.79 
 
 
1437 aa  1434    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  44.81 
 
 
1464 aa  1228    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  41.36 
 
 
1527 aa  961    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  43.92 
 
 
1407 aa  1082    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  48.29 
 
 
1444 aa  1333    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  47.2 
 
 
1435 aa  1319    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  42.7 
 
 
1421 aa  942    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  41.17 
 
 
1442 aa  1101    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  42.92 
 
 
1367 aa  934    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  44.51 
 
 
1426 aa  1050    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  38.51 
 
 
989 aa  566  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  56.12 
 
 
483 aa  552  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.78 
 
 
1153 aa  148  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  22.95 
 
 
1240 aa  147  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  22.94 
 
 
1176 aa  145  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  22.91 
 
 
1139 aa  144  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  23.53 
 
 
1165 aa  144  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  22.68 
 
 
1127 aa  142  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  22.77 
 
 
1130 aa  141  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  24.52 
 
 
1180 aa  140  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  23.94 
 
 
1145 aa  137  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  24.29 
 
 
1173 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  22.53 
 
 
1148 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  23.03 
 
 
1145 aa  133  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  23.26 
 
 
1181 aa  132  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  24.27 
 
 
1159 aa  131  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  22.4 
 
 
1148 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  22.1 
 
 
1156 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  22.85 
 
 
1177 aa  129  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  24.33 
 
 
1175 aa  128  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  22.08 
 
 
1122 aa  128  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  23.42 
 
 
1170 aa  127  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  22.1 
 
 
1155 aa  127  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  22.75 
 
 
1165 aa  127  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  21.3 
 
 
1225 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  22.71 
 
 
1170 aa  126  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  21.58 
 
 
1132 aa  125  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  23.31 
 
 
1170 aa  125  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  22.52 
 
 
1159 aa  125  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  21.83 
 
 
1184 aa  125  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  22.63 
 
 
1177 aa  124  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  21.83 
 
 
1157 aa  123  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  21.43 
 
 
1155 aa  123  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1114  DNA polymerase III subunit alpha  21.96 
 
 
1188 aa  122  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.98 
 
 
1122 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  24.05 
 
 
1607 aa  121  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2376  DNA polymerase III subunit alpha  22.54 
 
 
1178 aa  121  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51094 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  21.98 
 
 
1167 aa  120  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  22.37 
 
 
1139 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  22.76 
 
 
1156 aa  120  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  22.54 
 
 
1179 aa  119  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  22.66 
 
 
1174 aa  119  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12030  DNA-directed DNA polymerase III PolC  22.6 
 
 
1165 aa  119  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  20.64 
 
 
1164 aa  118  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2399  DNA polymerase III subunit alpha  22.74 
 
 
1190 aa  118  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351088  normal  0.331114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  22.42 
 
 
1159 aa  118  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  22.03 
 
 
1188 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  22.15 
 
 
1160 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  39.74 
 
 
560 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1296  DNA polymerase III, alpha subunit  22.11 
 
 
1181 aa  117  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  22.43 
 
 
1178 aa  116  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>