More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0689 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  46.69 
 
 		 1426 aa  1112    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  45.87 
 
 		 1436 aa  1313    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  42.36 
 
 		 970 aa  800    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  45.5 
 
 		 1468 aa  1296    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  48.72 
 
 		 1433 aa  1403    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  48.65 
 
 		 1433 aa  1409    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  48.72 
 
 		 1433 aa  1409    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  37.33 
 
 		 1493 aa  940    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  48.65 
 
 		 1433 aa  1409    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  48.49 
 
 		 1210 aa  826    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  50.8 
 
 		 1435 aa  1474    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  37.47 
 
 		 1442 aa  786    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  48.65 
 
 		 1433 aa  1409    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  40.43 
 
 		 1465 aa  879    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  48.65 
 
 		 1433 aa  1409    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  45.18 
 
 		 1397 aa  1091    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  44.1 
 
 		 1367 aa  978    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  38.51 
 
 		 1479 aa  969    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  50.54 
 
 		 1214 aa  879    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  42.72 
 
 		 1388 aa  942    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  48.79 
 
 		 1433 aa  1403    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  44.64 
 
 		 1433 aa  1142    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  48.93 
 
 		 1433 aa  1408    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  44.19 
 
 		 1367 aa  981    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  39.01 
 
 		 1365 aa  894    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  51.25 
 
 		 1444 aa  1488    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  46.37 
 
 		 1449 aa  1142    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  46.62 
 
 		 1449 aa  1146    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  46.59 
 
 		 1402 aa  1098    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  46.39 
 
 		 1212 aa  774    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  48.94 
 
 		 1635 aa  1268    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  51.79 
 
 		 1437 aa  1434    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  49.72 
 
 		 1432 aa  1431    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  100 
 
 		 1437 aa  2972    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  46.84 
 
 		 1438 aa  1332    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  46.48 
 
 		 1464 aa  1333    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  46.84 
 
 		 1438 aa  1332    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  38.16 
 
 		 1438 aa  857    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  44.4 
 
 		 1527 aa  1022    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  48.72 
 
 		 1433 aa  1409    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  42.69 
 
 		 1362 aa  932    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  44.35 
 
 		 1447 aa  1053    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  44.44 
 
 		 1407 aa  1162    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  48.9 
 
 		 1433 aa  1408    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  45.9 
 
 		 1440 aa  1141    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  53.87 
 
 		 1443 aa  1631    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  43.74 
 
 		 1390 aa  947    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  42.56 
 
 		 1421 aa  952    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  42.54 
 
 		 1442 aa  1171    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  61.57 
 
 		 483 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  38.31 
 
 		 989 aa  557  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  22.52 
 
 		 1176 aa  145  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  22.72 
 
 		 1139 aa  142  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  23.19 
 
 		 1240 aa  139  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  25.23 
 
 		 1180 aa  139  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  23.34 
 
 		 1130 aa  134  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  22.16 
 
 		 1132 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.23 
 
 		 1165 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  22.27 
 
 		 1127 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.06 
 
 		 1122 aa  132  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1148 aa  132  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  21.91 
 
 		 1145 aa  132  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  25.97 
 
 		 1607 aa  129  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1606  DNA polymerase III, alpha subunit  23.51 
 
 		 1187 aa  128  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.667733  normal  0.417005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  22.66 
 
 		 1075 aa  127  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  23.16 
 
 		 1148 aa  127  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.01 
 
 		 565 aa  125  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1296  DNA polymerase III, alpha subunit  22.77 
 
 		 1181 aa  126  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  23.37 
 
 		 1170 aa  125  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  23.18 
 
 		 1170 aa  125  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  21.42 
 
 		 1167 aa  125  7e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  36.78 
 
 		 560 aa  124  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  22.51 
 
 		 1155 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  22.75 
 
 		 1156 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.35 
 
 		 1170 aa  123  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  21.43 
 
 		 1184 aa  121  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  23.3 
 
 		 1177 aa  121  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  22.56 
 
 		 1179 aa  121  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  23.12 
 
 		 1177 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  28.28 
 
 		 1228 aa  120  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  23.09 
 
 		 1180 aa  120  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  23.44 
 
 		 1157 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  22.03 
 
 		 1159 aa  119  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  33.18 
 
 		 616 aa  119  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  23.64 
 
 		 1174 aa  119  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  37.91 
 
 		 574 aa  118  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  22.91 
 
 		 1181 aa  118  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2376  DNA polymerase III subunit alpha  22.33 
 
 		 1178 aa  118  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.48 
 
 		 584 aa  117  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  21.8 
 
 		 1476 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22680  DNA polymerase III, alpha subunit  23.49 
 
 		 1181 aa  117  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.149072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  20.49 
 
 		 1510 aa  116  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  21.63 
 
 		 1454 aa  115  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1114  DNA polymerase III subunit alpha  22.88 
 
 		 1188 aa  115  9e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10990  DNA polymerase III subunit alpha  23.07 
 
 		 1191 aa  114  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.997232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3172  DNA polymerase III subunit alpha  23.21 
 
 		 1175 aa  114  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.450877  hitchhiker  0.0000979148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.71 
 
 		 605 aa  114  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2399  DNA polymerase III subunit alpha  21.61 
 
 		 1190 aa  113  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351088  normal  0.331114 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.42 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3245  DNA polymerase III, alpha subunit  23.26 
 
 		 1185 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>