More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3859 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  51.59 
 
 		 1436 aa  1003    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  98.76 
 
 		 1433 aa  1986    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 970 aa  2008    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  44.92 
 
 		 1468 aa  845    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  48.34 
 
 		 1433 aa  726    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  67.8 
 
 		 1435 aa  1388    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  98.76 
 
 		 1433 aa  1986    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  98.86 
 
 		 1433 aa  1987    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  98.76 
 
 		 1433 aa  1986    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  92.46 
 
 		 1433 aa  1879    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  65.08 
 
 		 1444 aa  1335    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  42.4 
 
 		 1442 aa  737    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  47.9 
 
 		 1443 aa  951    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  98.76 
 
 		 1433 aa  1986    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  51.79 
 
 		 1438 aa  1013    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  51.79 
 
 		 1438 aa  1013    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  97.93 
 
 		 1433 aa  1971    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  47.59 
 
 		 1440 aa  776    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  44.77 
 
 		 1527 aa  643    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  44.77 
 
 		 1449 aa  759    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  44.66 
 
 		 1449 aa  759    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  47.89 
 
 		 1397 aa  724    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  96.38 
 
 		 1433 aa  1942    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  46.68 
 
 		 1402 aa  690    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  47.27 
 
 		 1407 aa  723    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  52.03 
 
 		 1635 aa  793    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  40.37 
 
 		 1437 aa  697    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  44.65 
 
 		 1432 aa  837    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  42.36 
 
 		 1437 aa  800    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  43.67 
 
 		 1464 aa  838    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  98.86 
 
 		 1433 aa  1987    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  98.35 
 
 		 1433 aa  1980    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  44.51 
 
 		 1426 aa  773    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  43.22 
 
 		 1421 aa  629  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  42.93 
 
 		 1447 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  41.54 
 
 		 1367 aa  580  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  41.3 
 
 		 1367 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  42.86 
 
 		 1390 aa  562  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  42.93 
 
 		 1362 aa  555  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  39.04 
 
 		 1365 aa  547  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  34.44 
 
 		 1479 aa  536  1e-151  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  40.49 
 
 		 1388 aa  533  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  35.02 
 
 		 1493 aa  528  1e-148  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  40.43 
 
 		 1465 aa  526  1e-148  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  35.16 
 
 		 1442 aa  452  1e-125  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  30.74 
 
 		 1438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  52.2 
 
 		 1214 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  53.74 
 
 		 1210 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  52.59 
 
 		 1212 aa  399  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  41.08 
 
 		 989 aa  273  9e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  38.1 
 
 		 551 aa  145  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  37.75 
 
 		 584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.11 
 
 		 584 aa  137  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.88 
 
 		 921 aa  137  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.75 
 
 		 595 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.82 
 
 		 565 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  43.33 
 
 		 560 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  35.85 
 
 		 570 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 		 707 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  39.34 
 
 		 574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.14 
 
 		 631 aa  129  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  35.4 
 
 		 616 aa  129  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  37.14 
 
 		 590 aa  129  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  39.18 
 
 		 578 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  35.6 
 
 		 578 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  37.24 
 
 		 574 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  30.84 
 
 		 1228 aa  124  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  42.36 
 
 		 315 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  42.36 
 
 		 315 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  34.05 
 
 		 315 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  42.07 
 
 		 315 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.24 
 
 		 218 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  42.36 
 
 		 315 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3411  DNA-directed DNA polymerase  39.04 
 
 		 215 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.537666  normal  0.0817359 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.37 
 
 		 1170 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  36.13 
 
 		 720 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  39.77 
 
 		 566 aa  122  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  41.67 
 
 		 315 aa  121  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.02 
 
 		 479 aa  121  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  41.67 
 
 		 315 aa  121  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  36.02 
 
 		 617 aa  121  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  41.67 
 
 		 315 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.64 
 
 		 769 aa  120  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  37.43 
 
 		 729 aa  120  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  41.67 
 
 		 315 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.66 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  36.87 
 
 		 695 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.64 
 
 		 715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.5 
 
 		 695 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  29.94 
 
 		 1127 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.75 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1148 aa  119  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  28.61 
 
 		 1148 aa  119  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.42 
 
 		 921 aa  119  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.53 
 
 		 930 aa  119  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.87 
 
 		 695 aa  119  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 714 aa  119  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.89 
 
 		 219 aa  119  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  41.67 
 
 		 299 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  37.72 
 
 		 954 aa  117  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>