More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0342 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  46.32 
 
 		 1438 aa  1094    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  45.76 
 
 		 1436 aa  1084    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  39.78 
 
 		 1438 aa  853    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1367 aa  2782    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  46.01 
 
 		 1443 aa  1088    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  44.87 
 
 		 1468 aa  993    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  44.06 
 
 		 989 aa  675    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  46.96 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  98.98 
 
 		 1367 aa  2759    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  47.04 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  47.11 
 
 		 1433 aa  1123    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  41.35 
 
 		 1493 aa  928    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  47.04 
 
 		 1433 aa  1126    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  46.96 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  55.17 
 
 		 1390 aa  1488    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  50.37 
 
 		 1440 aa  1196    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  50.57 
 
 		 1210 aa  881    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  49.26 
 
 		 1444 aa  1177    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  48.29 
 
 		 1433 aa  1160    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  42.17 
 
 		 1365 aa  985    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  46.96 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  46.93 
 
 		 1447 aa  1122    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  38.45 
 
 		 1442 aa  810    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  55.15 
 
 		 1388 aa  1344    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  43.73 
 
 		 1479 aa  990    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  53.94 
 
 		 1214 aa  941    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  46.32 
 
 		 1438 aa  1094    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  43.57 
 
 		 1465 aa  984    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  51.51 
 
 		 1402 aa  1222    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  50.81 
 
 		 1397 aa  1232    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  46.45 
 
 		 1527 aa  1061    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  47.48 
 
 		 1435 aa  1190    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  48.97 
 
 		 1407 aa  1242    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  47.44 
 
 		 1449 aa  1161    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  48.59 
 
 		 1449 aa  1163    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  46.24 
 
 		 1421 aa  1050    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  48.83 
 
 		 1426 aa  1176    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  54.23 
 
 		 1212 aa  939    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  47.76 
 
 		 1433 aa  1113    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  43.78 
 
 		 1635 aa  999    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  42.92 
 
 		 1437 aa  934    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  47.09 
 
 		 1432 aa  1041    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  44.1 
 
 		 1437 aa  978    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  44.14 
 
 		 1464 aa  1013    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  50 
 
 		 1442 aa  1186    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  47.84 
 
 		 1433 aa  1114    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  46.96 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  48.53 
 
 		 1433 aa  1134    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  55.29 
 
 		 1362 aa  1429    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  41.3 
 
 		 970 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  56.36 
 
 		 483 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  26.93 
 
 		 1170 aa  184  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  26.29 
 
 		 1170 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  24.45 
 
 		 1184 aa  181  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  24.56 
 
 		 1157 aa  181  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  26.66 
 
 		 1170 aa  180  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  24.97 
 
 		 1127 aa  179  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  23.63 
 
 		 1179 aa  179  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  23.89 
 
 		 1176 aa  177  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  23.64 
 
 		 1132 aa  174  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  23.97 
 
 		 1156 aa  174  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.4 
 
 		 1139 aa  173  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  24.08 
 
 		 1145 aa  173  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  23.37 
 
 		 1178 aa  172  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  23 
 
 		 1148 aa  172  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  24.05 
 
 		 1155 aa  172  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  24.39 
 
 		 1155 aa  171  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  24.84 
 
 		 1225 aa  171  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  24.09 
 
 		 1156 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  24.49 
 
 		 1151 aa  168  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  23.59 
 
 		 1155 aa  168  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  23.16 
 
 		 1214 aa  166  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.51 
 
 		 1075 aa  165  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.58 
 
 		 1165 aa  165  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  24.36 
 
 		 1165 aa  165  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  24.4 
 
 		 1145 aa  164  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.18 
 
 		 1153 aa  164  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  24.26 
 
 		 1180 aa  163  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  23.16 
 
 		 1167 aa  161  7e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  22.71 
 
 		 1240 aa  161  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  23.86 
 
 		 1228 aa  160  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24 
 
 		 1134 aa  159  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  23.47 
 
 		 1130 aa  159  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  23.96 
 
 		 1181 aa  159  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  23.97 
 
 		 1177 aa  158  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  23.69 
 
 		 1164 aa  158  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.78 
 
 		 1182 aa  158  8e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.7 
 
 		 1165 aa  157  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  24.43 
 
 		 1174 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  23.38 
 
 		 1177 aa  154  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  23.78 
 
 		 1188 aa  153  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  26.45 
 
 		 1607 aa  152  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  23.58 
 
 		 1201 aa  152  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.69 
 
 		 1122 aa  152  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  22.93 
 
 		 1172 aa  150  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  21.99 
 
 		 1331 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  22.67 
 
 		 1171 aa  150  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  22.49 
 
 		 1172 aa  150  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  23.42 
 
 		 1162 aa  149  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  23.32 
 
 		 1177 aa  148  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>