More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0420 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  39.11 
 
 		 1433 aa  874    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  38.4 
 
 		 1433 aa  913    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  37.42 
 
 		 1447 aa  791    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  38.14 
 
 		 1436 aa  867    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  36.71 
 
 		 1421 aa  757    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  41.74 
 
 		 1438 aa  928    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  37.23 
 
 		 1465 aa  709    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  35.65 
 
 		 1468 aa  802    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  35.4 
 
 		 1527 aa  742    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  38.7 
 
 		 1433 aa  921    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  38.63 
 
 		 1433 aa  920    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  45.06 
 
 		 1493 aa  961    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  38.7 
 
 		 1433 aa  921    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  39.61 
 
 		 1402 aa  841    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  38.73 
 
 		 1438 aa  867    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  38.29 
 
 		 1433 aa  920    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  39.9 
 
 		 1435 aa  926    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  39.98 
 
 		 1407 aa  832    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  37.88 
 
 		 1443 aa  853    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  41.21 
 
 		 1210 aa  659    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  38.7 
 
 		 1433 aa  921    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  39.22 
 
 		 1397 aa  857    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  38.7 
 
 		 1433 aa  921    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  42.79 
 
 		 1479 aa  974    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  39 
 
 		 1214 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  40.33 
 
 		 1390 aa  821    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  38.7 
 
 		 1433 aa  920    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  39.13 
 
 		 1388 aa  794    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  40.1 
 
 		 1433 aa  917    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  39.98 
 
 		 1444 aa  927    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1442 aa  2945    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  38.63 
 
 		 1367 aa  811    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  38.73 
 
 		 1438 aa  867    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  38.61 
 
 		 1367 aa  811    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  37.16 
 
 		 1449 aa  840    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  37.23 
 
 		 1449 aa  842    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  36.52 
 
 		 1365 aa  715    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  37.88 
 
 		 1440 aa  888    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  38.47 
 
 		 1433 aa  916    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  41.7 
 
 		 1212 aa  675    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  38.57 
 
 		 1426 aa  886    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  36.73 
 
 		 1635 aa  805    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  39.65 
 
 		 1437 aa  761    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  37.79 
 
 		 1432 aa  850    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  34.73 
 
 		 1437 aa  791    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  35.87 
 
 		 1464 aa  832    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  37.35 
 
 		 1442 aa  845    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  39.72 
 
 		 1362 aa  768    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  34.23 
 
 		 989 aa  482  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  47 
 
 		 483 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  33.49 
 
 		 970 aa  458  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.09 
 
 		 921 aa  103  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  21.59 
 
 		 1127 aa  103  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3501  DNA polymerase III, alpha subunit  20.9 
 
 		 1194 aa  100  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  21.14 
 
 		 1155 aa  99  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  21.13 
 
 		 1156 aa  97.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  21.17 
 
 		 1130 aa  95.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  23.5 
 
 		 1607 aa  94.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1898  DNA polymerase III, alpha subunit  22.19 
 
 		 1179 aa  93.6  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  22.19 
 
 		 1187 aa  93.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  21.73 
 
 		 1180 aa  94  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  23.81 
 
 		 1163 aa  92.4  5e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  20.37 
 
 		 1156 aa  92  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  20.86 
 
 		 1157 aa  91.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  21.31 
 
 		 1145 aa  91.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1030  Rad3-related DNA helicase  36.42 
 
 		 937 aa  90.9  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0174435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  21.54 
 
 		 1179 aa  90.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0980  DNA polymerase III, alpha subunit  22.76 
 
 		 1188 aa  89.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  22.65 
 
 		 1165 aa  89  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  20.93 
 
 		 1155 aa  89  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  22.09 
 
 		 1190 aa  88.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  22.4 
 
 		 1201 aa  88.2  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2040  DNA polymerase III, alpha subunit  22.5 
 
 		 1185 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  33.54 
 
 		 240 aa  88.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4484  DNA polymerase III, alpha subunit  23.6 
 
 		 1186 aa  86.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  32.92 
 
 		 245 aa  86.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  23.81 
 
 		 1158 aa  86.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.37 
 
 		 921 aa  85.9  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  32.14 
 
 		 584 aa  85.9  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.5 
 
 		 205 aa  84.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  34.27 
 
 		 238 aa  85.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002762  DNA polymerase III alpha subunit  22.34 
 
 		 1159 aa  84  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0153  DNA polymerase III subunit alpha  23.17 
 
 		 1193 aa  84  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  22.86 
 
 		 1174 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  21.75 
 
 		 1122 aa  84  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  31.06 
 
 		 242 aa  84  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  32.03 
 
 		 560 aa  84.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  22.04 
 
 		 1143 aa  83.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  22.92 
 
 		 1167 aa  83.2  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.32 
 
 		 909 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  20.83 
 
 		 1181 aa  83.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  22.18 
 
 		 1139 aa  83.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.12 
 
 		 952 aa  83.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0174  DNA polymerase III subunit alpha  23.02 
 
 		 1193 aa  83.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.224841  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0892  DNA polymerase III subunit alpha  21.99 
 
 		 1197 aa  83.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0260823  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  28.37 
 
 		 695 aa  83.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.92 
 
 		 706 aa  82.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.37 
 
 		 695 aa  82.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  22.04 
 
 		 1143 aa  82.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 695 aa  82.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>