More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0339 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  43.6 
 
 		 1438 aa  1042    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  42.98 
 
 		 1436 aa  1040    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  40.7 
 
 		 1421 aa  900    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  40.12 
 
 		 1438 aa  973    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  38.35 
 
 		 1468 aa  991    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  42.13 
 
 		 1447 aa  948    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  41.1 
 
 		 1433 aa  1065    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  41.03 
 
 		 1433 aa  1064    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  44.1 
 
 		 1402 aa  999    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  60.7 
 
 		 1493 aa  1810    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  43.68 
 
 		 1397 aa  1039    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  41.1 
 
 		 1433 aa  1065    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  43.9 
 
 		 1210 aa  753    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  41.1 
 
 		 1433 aa  1065    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  39.76 
 
 		 1388 aa  890    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  41.22 
 
 		 1433 aa  1062    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  42.59 
 
 		 1444 aa  1119    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  37.1 
 
 		 1365 aa  829    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  43.03 
 
 		 1433 aa  1026    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  41.1 
 
 		 1433 aa  1065    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  42.19 
 
 		 1433 aa  1067    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  40.9 
 
 		 1433 aa  1060    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  42.77 
 
 		 1443 aa  1027    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1479 aa  3019    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  45.01 
 
 		 1214 aa  791    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  43.73 
 
 		 1367 aa  990    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  36.94 
 
 		 1465 aa  819    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  43 
 
 		 1442 aa  1008    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  40.83 
 
 		 1433 aa  1061    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  42.66 
 
 		 1435 aa  1115    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  43.76 
 
 		 1442 aa  968    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  41.7 
 
 		 1440 aa  1007    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  43.65 
 
 		 1367 aa  983    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  42.68 
 
 		 1449 aa  957    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  42.68 
 
 		 1449 aa  956    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  41.17 
 
 		 1433 aa  1066    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  42.96 
 
 		 1362 aa  936    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  45.15 
 
 		 1212 aa  760    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  41.16 
 
 		 1635 aa  937    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  41.5 
 
 		 1437 aa  926    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  42.91 
 
 		 1432 aa  1053    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  38.51 
 
 		 1437 aa  969    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  37.46 
 
 		 1464 aa  996    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  41.15 
 
 		 1527 aa  925    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  43.6 
 
 		 1438 aa  1042    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  41.93 
 
 		 1426 aa  1010    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  44.67 
 
 		 1390 aa  978    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  40.82 
 
 		 1407 aa  988    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  37.84 
 
 		 989 aa  543  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  34.44 
 
 		 970 aa  536  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  54.24 
 
 		 483 aa  530  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  22.17 
 
 		 1176 aa  162  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  22.99 
 
 		 1167 aa  161  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  22.97 
 
 		 1225 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.71 
 
 		 1165 aa  142  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  22.91 
 
 		 1127 aa  142  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  23.26 
 
 		 1130 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  22.99 
 
 		 1170 aa  138  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  22.88 
 
 		 1240 aa  137  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.36 
 
 		 1122 aa  137  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  23.31 
 
 		 1156 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  22.51 
 
 		 1170 aa  135  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  23.42 
 
 		 1145 aa  135  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  22.51 
 
 		 1170 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  23.93 
 
 		 1228 aa  133  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  23.32 
 
 		 1155 aa  133  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  21.54 
 
 		 1155 aa  131  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  21.68 
 
 		 1163 aa  130  2.0000000000000002e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  24.11 
 
 		 1476 aa  127  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  22.08 
 
 		 1139 aa  128  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  22.82 
 
 		 1158 aa  128  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  23.14 
 
 		 1181 aa  127  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  22.46 
 
 		 1145 aa  125  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  23.18 
 
 		 1510 aa  125  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  22.75 
 
 		 1155 aa  125  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  21.97 
 
 		 1164 aa  124  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  22.76 
 
 		 1148 aa  123  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0045  DNA polymerase III, alpha subunit  22.98 
 
 		 1163 aa  123  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0276181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  23.93 
 
 		 1454 aa  123  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  21.73 
 
 		 1179 aa  123  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  23.21 
 
 		 1180 aa  122  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  24.69 
 
 		 1607 aa  120  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  22.74 
 
 		 1160 aa  120  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  22.92 
 
 		 1160 aa  119  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  22.74 
 
 		 1171 aa  118  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  22.74 
 
 		 1160 aa  118  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  21.94 
 
 		 1171 aa  118  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  22.33 
 
 		 1157 aa  118  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  21.95 
 
 		 1134 aa  118  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  22.61 
 
 		 1160 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  22.61 
 
 		 1160 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  22.61 
 
 		 1160 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  22.61 
 
 		 1160 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1160 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  22.61 
 
 		 1160 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  22.6 
 
 		 1201 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  22.61 
 
 		 1160 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  22.61 
 
 		 1160 aa  116  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  21.69 
 
 		 1132 aa  115  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  23.94 
 
 		 1122 aa  115  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>