More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1427 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1440 aa  2954    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  50.5 
 
 		 1436 aa  1333    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  65.82 
 
 		 483 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  47.59 
 
 		 970 aa  775    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  46.79 
 
 		 1468 aa  1197    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  37.88 
 
 		 1442 aa  888    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  54.71 
 
 		 1435 aa  1464    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  54.36 
 
 		 1433 aa  1417    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  54.28 
 
 		 1433 aa  1415    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  40.62 
 
 		 1493 aa  962    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  54.36 
 
 		 1433 aa  1417    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  46.96 
 
 		 1362 aa  1114    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  48.94 
 
 		 1388 aa  1156    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  50.23 
 
 		 1438 aa  1319    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  54.21 
 
 		 1433 aa  1414    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  50.89 
 
 		 1443 aa  1268    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  54.36 
 
 		 1433 aa  1417    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  54.35 
 
 		 1210 aa  994    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  48.64 
 
 		 1527 aa  1186    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  41.7 
 
 		 1479 aa  1006    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  58.45 
 
 		 1214 aa  997    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  55.81 
 
 		 1433 aa  1420    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  56.01 
 
 		 1433 aa  1429    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  44 
 
 		 1365 aa  1102    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  52.12 
 
 		 1426 aa  1400    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  49.55 
 
 		 1442 aa  1417    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  48.35 
 
 		 1390 aa  1125    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  50.23 
 
 		 1438 aa  1319    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  50.37 
 
 		 1367 aa  1197    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  53.63 
 
 		 1449 aa  1381    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  51.35 
 
 		 1449 aa  1382    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  53.92 
 
 		 1402 aa  1342    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  54.21 
 
 		 1433 aa  1414    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  51.33 
 
 		 1397 aa  1385    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  56.94 
 
 		 1212 aa  1011    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  47.32 
 
 		 1635 aa  1164    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  45.39 
 
 		 1437 aa  1083    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  47.22 
 
 		 1432 aa  1228    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  45.9 
 
 		 1437 aa  1142    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  45.62 
 
 		 1464 aa  1193    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  56.87 
 
 		 1444 aa  1473    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  54.36 
 
 		 1433 aa  1417    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  39.69 
 
 		 1438 aa  897    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  54.21 
 
 		 1433 aa  1415    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  50.12 
 
 		 1447 aa  1222    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  52.66 
 
 		 1433 aa  1409    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  44.26 
 
 		 1465 aa  1046    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  49.05 
 
 		 1421 aa  1185    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  50.54 
 
 		 1367 aa  1201    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  53.25 
 
 		 1407 aa  1425    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  39.67 
 
 		 989 aa  607  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  23.15 
 
 		 1127 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1148 aa  164  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.67 
 
 		 1165 aa  162  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  23.18 
 
 		 1184 aa  161  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  23.96 
 
 		 1157 aa  159  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  25.94 
 
 		 1139 aa  159  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  45.31 
 
 		 578 aa  159  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  22.83 
 
 		 1167 aa  157  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2412  DNA polymerase III subunit alpha  24.25 
 
 		 1159 aa  157  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  25.7 
 
 		 1228 aa  155  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  23.74 
 
 		 1176 aa  154  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  24.3 
 
 		 1160 aa  153  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  24.3 
 
 		 1171 aa  154  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  24.3 
 
 		 1171 aa  153  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  22.42 
 
 		 1170 aa  153  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  23.86 
 
 		 1156 aa  152  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.39 
 
 		 595 aa  153  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  23.38 
 
 		 1130 aa  153  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  25.69 
 
 		 1180 aa  152  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.7 
 
 		 1075 aa  152  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  24.35 
 
 		 1158 aa  152  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  23.65 
 
 		 1225 aa  152  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  22.31 
 
 		 1170 aa  152  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  22.38 
 
 		 1170 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  23.48 
 
 		 1156 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  26.36 
 
 		 1607 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  23.8 
 
 		 1179 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  22.04 
 
 		 1240 aa  150  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  24.59 
 
 		 1154 aa  149  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  46.41 
 
 		 574 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  23.34 
 
 		 1181 aa  149  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1296  DNA polymerase III, alpha subunit  23.92 
 
 		 1181 aa  148  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  24.42 
 
 		 1178 aa  148  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  25.13 
 
 		 1145 aa  147  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  22.35 
 
 		 1148 aa  147  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  44.51 
 
 		 590 aa  147  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  23.14 
 
 		 1155 aa  146  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  23.62 
 
 		 1162 aa  146  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  23.45 
 
 		 1155 aa  145  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  47.62 
 
 		 560 aa  145  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  23.63 
 
 		 1151 aa  145  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  44.04 
 
 		 574 aa  144  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3775  DNA polymerase III subunit alpha  24.29 
 
 		 1162 aa  144  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998036 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  22.88 
 
 		 1132 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.18 
 
 		 609 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  44.02 
 
 		 630 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  35.99 
 
 		 617 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03222  DNA polymerase III subunit alpha  23.81 
 
 		 1143 aa  143  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  21.09 
 
 		 1510 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>