More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0598 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  45.15 
 
 		 1435 aa  1064    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  40.9 
 
 		 1436 aa  996    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  42.69 
 
 		 1388 aa  968    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  44 
 
 		 1440 aa  1102    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  41.7 
 
 		 1362 aa  927    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  39.82 
 
 		 1468 aa  922    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  45.48 
 
 		 1444 aa  1068    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  43.4 
 
 		 1433 aa  1036    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  43.48 
 
 		 1433 aa  1037    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  37.78 
 
 		 1493 aa  815    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  44.86 
 
 		 1402 aa  1070    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  43.4 
 
 		 1433 aa  1036    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  42.83 
 
 		 1447 aa  997    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  41.37 
 
 		 1438 aa  993    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  44.03 
 
 		 1433 aa  1043    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  42.17 
 
 		 1367 aa  985    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1365 aa  2797    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  41.21 
 
 		 1443 aa  991    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  46.96 
 
 		 1407 aa  1166    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  43.64 
 
 		 1433 aa  1038    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  43.49 
 
 		 1433 aa  1039    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  43.17 
 
 		 1433 aa  1030    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  43.4 
 
 		 1433 aa  1036    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  42.25 
 
 		 1367 aa  985    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  37.1 
 
 		 1479 aa  829    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  49.1 
 
 		 1214 aa  837    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  42.91 
 
 		 1527 aa  1014    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  43.48 
 
 		 1433 aa  1036    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  49.09 
 
 		 1210 aa  823    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  36.52 
 
 		 1442 aa  715    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  45.95 
 
 		 1449 aa  1113    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  46.04 
 
 		 1449 aa  1114    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  41.68 
 
 		 1465 aa  951    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  47.39 
 
 		 1397 aa  1126    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  44.03 
 
 		 1426 aa  1056    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  48.55 
 
 		 1212 aa  830    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  43.71 
 
 		 1421 aa  1032    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  42.93 
 
 		 1390 aa  949    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  36.14 
 
 		 1438 aa  765    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  38.49 
 
 		 1635 aa  892    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  39.87 
 
 		 1437 aa  899    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  41.19 
 
 		 1432 aa  991    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  39.01 
 
 		 1437 aa  894    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  37.25 
 
 		 1464 aa  933    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  43.4 
 
 		 1433 aa  1036    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  41.37 
 
 		 1438 aa  993    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  46.42 
 
 		 1442 aa  1135    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  43.35 
 
 		 1433 aa  1101    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  39.85 
 
 		 989 aa  564  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  39.04 
 
 		 970 aa  547  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  50.95 
 
 		 483 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.18 
 
 		 595 aa  144  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.42 
 
 		 921 aa  141  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.79 
 
 		 595 aa  138  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  36.32 
 
 		 578 aa  137  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.91 
 
 		 205 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  36.59 
 
 		 617 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  35.68 
 
 		 590 aa  132  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  41.52 
 
 		 578 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  37.56 
 
 		 645 aa  130  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  38.95 
 
 		 584 aa  129  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.2 
 
 		 565 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  22.86 
 
 		 1145 aa  128  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  41.52 
 
 		 613 aa  128  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  22.75 
 
 		 1127 aa  128  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  36.55 
 
 		 630 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  40.23 
 
 		 584 aa  125  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  37.43 
 
 		 570 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  36.04 
 
 		 630 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.15 
 
 		 610 aa  124  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  36.04 
 
 		 630 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  35.02 
 
 		 551 aa  123  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.36 
 
 		 479 aa  122  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  38.82 
 
 		 720 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.41 
 
 		 719 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.52 
 
 		 731 aa  119  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  39.64 
 
 		 616 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  22.81 
 
 		 1181 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.03 
 
 		 721 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.14 
 
 		 769 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  36.7 
 
 		 574 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  23.52 
 
 		 1240 aa  115  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  36.18 
 
 		 601 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  35.89 
 
 		 603 aa  115  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.82 
 
 		 706 aa  115  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  22.73 
 
 		 1148 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  38.5 
 
 		 574 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.33 
 
 		 453 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.18 
 
 		 584 aa  114  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  22.61 
 
 		 1153 aa  113  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 		 929 aa  114  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  37.57 
 
 		 585 aa  114  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.6 
 
 		 609 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.37 
 
 		 1134 aa  113  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.08 
 
 		 921 aa  113  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5151  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.12 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  23.28 
 
 		 1178 aa  112  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.25 
 
 		 449 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.87 
 
 		 659 aa  112  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.67 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>