More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1650 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  39.98 
 
 
1442 aa  830    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  52.92 
 
 
1527 aa  1348    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  53.11 
 
 
1433 aa  1345    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  50.51 
 
 
1436 aa  1268    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  47.27 
 
 
1362 aa  1142    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  47.27 
 
 
970 aa  723    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  44.62 
 
 
1468 aa  1170    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  59.53 
 
 
1433 aa  1571    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  53.11 
 
 
1433 aa  1345    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  38.68 
 
 
1438 aa  863    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  52.49 
 
 
1435 aa  1410    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  53.03 
 
 
1433 aa  1343    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  42.39 
 
 
1493 aa  973    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  58.67 
 
 
1397 aa  1506    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  53.11 
 
 
1433 aa  1345    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  47.15 
 
 
1465 aa  1110    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  57.88 
 
 
1442 aa  1667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  52.95 
 
 
1433 aa  1342    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  53.11 
 
 
1433 aa  1343    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  58.17 
 
 
1210 aa  1068    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  48.97 
 
 
1367 aa  1244    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  50.49 
 
 
1444 aa  1391    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  54.05 
 
 
1433 aa  1365    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  50.49 
 
 
1447 aa  1390    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  53.11 
 
 
1433 aa  1345    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  40.82 
 
 
1479 aa  990    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  63.03 
 
 
1214 aa  1124    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  52.75 
 
 
1433 aa  1339    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  46.96 
 
 
1365 aa  1166    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  50.04 
 
 
1390 aa  1146    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  53.25 
 
 
1440 aa  1426    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  50.99 
 
 
1438 aa  1277    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  100 
 
 
1407 aa  2853    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  50.99 
 
 
1438 aa  1277    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  56.37 
 
 
1449 aa  1620    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  55.64 
 
 
1426 aa  1548    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  56.44 
 
 
1449 aa  1625    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  46.9 
 
 
1388 aa  1159    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  50.16 
 
 
1421 aa  1222    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  57.52 
 
 
1212 aa  1097    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  47.53 
 
 
1635 aa  1171    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  43.92 
 
 
1437 aa  1082    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  46.84 
 
 
1432 aa  1240    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  43.98 
 
 
1437 aa  1167    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  43.28 
 
 
1464 aa  1162    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  50.37 
 
 
1443 aa  1268    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  49.24 
 
 
1367 aa  1248    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  57.54 
 
 
1402 aa  1557    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  52.91 
 
 
1433 aa  1342    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  62.42 
 
 
483 aa  626  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  39.55 
 
 
989 aa  620  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  24.03 
 
 
1148 aa  186  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  24.42 
 
 
1127 aa  181  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  25.25 
 
 
1145 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  23.15 
 
 
1240 aa  169  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  43.52 
 
 
616 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  40.49 
 
 
584 aa  165  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.5 
 
 
605 aa  160  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.8 
 
 
1139 aa  158  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  40.19 
 
 
551 aa  158  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.1 
 
 
595 aa  158  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.07 
 
 
1170 aa  156  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  25.05 
 
 
1122 aa  155  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  24.12 
 
 
1170 aa  155  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  24.02 
 
 
1167 aa  154  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.9 
 
 
584 aa  154  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  26.15 
 
 
1607 aa  153  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  23.45 
 
 
1164 aa  154  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  24.75 
 
 
1165 aa  153  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  22.58 
 
 
1176 aa  153  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  24.37 
 
 
1181 aa  152  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  23.97 
 
 
1170 aa  152  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  23.73 
 
 
1145 aa  152  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  23.84 
 
 
1151 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  44.44 
 
 
560 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  41.11 
 
 
570 aa  149  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.58 
 
 
631 aa  149  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  38.89 
 
 
574 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  24.86 
 
 
1228 aa  147  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.11 
 
 
1075 aa  147  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  41.54 
 
 
578 aa  147  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  23.83 
 
 
1485 aa  147  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.28 
 
 
595 aa  146  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.09 
 
 
609 aa  146  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  33.22 
 
 
574 aa  145  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  24.59 
 
 
1165 aa  145  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  24.41 
 
 
1180 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  37.44 
 
 
566 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  24.13 
 
 
1225 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  22.99 
 
 
1130 aa  142  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  36.77 
 
 
603 aa  142  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  42.41 
 
 
707 aa  141  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.13 
 
 
205 aa  141  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  23.29 
 
 
1157 aa  140  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  23.84 
 
 
1153 aa  140  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  40.88 
 
 
590 aa  140  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  43.02 
 
 
601 aa  140  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.57 
 
 
721 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.11 
 
 
769 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  22.75 
 
 
1178 aa  139  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>