More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0332 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  43.48 
 
 		 1433 aa  995    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  42.68 
 
 		 1436 aa  976    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  43.81 
 
 		 1402 aa  1042    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  40.83 
 
 		 1443 aa  941    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  41.16 
 
 		 1468 aa  937    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  44.29 
 
 		 1435 aa  1036    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  41.68 
 
 		 1365 aa  951    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  44.26 
 
 		 1440 aa  1047    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  41.48 
 
 		 1433 aa  999    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  52.29 
 
 		 1421 aa  1465    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  41.55 
 
 		 1433 aa  1000    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  38.54 
 
 		 1493 aa  794    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  41.48 
 
 		 1433 aa  999    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  47.18 
 
 		 1397 aa  1108    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  43.73 
 
 		 1367 aa  988    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  43.26 
 
 		 1388 aa  952    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  45.28 
 
 		 1210 aa  753    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  37.23 
 
 		 1442 aa  707    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  41.48 
 
 		 1433 aa  999    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  40.93 
 
 		 1438 aa  969    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  45.67 
 
 		 1433 aa  1085    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  36.97 
 
 		 1479 aa  822    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  43.28 
 
 		 1214 aa  800    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  36.6 
 
 		 1438 aa  776    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  43.76 
 
 		 1527 aa  1010    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  43.64 
 
 		 1433 aa  998    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  40.93 
 
 		 1438 aa  969    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  47.15 
 
 		 1407 aa  1110    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  44.9 
 
 		 1426 aa  1035    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  42.95 
 
 		 1390 aa  944    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  42.78 
 
 		 1362 aa  912    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  46.03 
 
 		 1449 aa  1072    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  46.03 
 
 		 1449 aa  1073    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  41.22 
 
 		 1433 aa  999    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  44.76 
 
 		 1212 aa  768    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  44.58 
 
 		 1444 aa  1031    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  44.27 
 
 		 1442 aa  1083    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  40.98 
 
 		 1635 aa  940    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  39.81 
 
 		 1437 aa  858    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  43.57 
 
 		 1367 aa  983    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  41.46 
 
 		 1432 aa  966    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  40.43 
 
 		 1437 aa  879    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  41.16 
 
 		 1464 aa  938    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  41.48 
 
 		 1433 aa  999    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1465 aa  2976    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  41.43 
 
 		 1447 aa  1038    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  41.41 
 
 		 1433 aa  998    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  43.71 
 
 		 1433 aa  998    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  36.89 
 
 		 989 aa  555  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  40.43 
 
 		 970 aa  526  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  47.96 
 
 		 483 aa  476  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  23.56 
 
 		 1127 aa  152  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.44 
 
 		 595 aa  151  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  24.06 
 
 		 1145 aa  146  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  23.96 
 
 		 1240 aa  143  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  23.27 
 
 		 1181 aa  143  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  38 
 
 		 578 aa  143  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.45 
 
 		 605 aa  143  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  23.43 
 
 		 1476 aa  142  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  40.66 
 
 		 574 aa  141  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  40.78 
 
 		 570 aa  140  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  43.5 
 
 		 574 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  38.78 
 
 		 584 aa  139  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  42.26 
 
 		 578 aa  139  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  39.46 
 
 		 566 aa  137  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.22 
 
 		 584 aa  136  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0921  DNA polymerase III, alpha subunit  22.89 
 
 		 1190 aa  135  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85722  normal  0.700472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.71 
 
 		 631 aa  134  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  37.16 
 
 		 551 aa  134  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.12 
 
 		 609 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  37.7 
 
 		 590 aa  134  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.8 
 
 		 595 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  22.97 
 
 		 1159 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  36.82 
 
 		 613 aa  134  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  35.78 
 
 		 617 aa  132  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  22.59 
 
 		 1156 aa  131  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  36.84 
 
 		 616 aa  131  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  40.23 
 
 		 584 aa  131  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  22.49 
 
 		 1510 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  37.57 
 
 		 630 aa  131  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1547  DNA polymerase III, alpha subunit  23.65 
 
 		 1189 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  38.17 
 
 		 601 aa  131  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  40.45 
 
 		 601 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  23.75 
 
 		 1162 aa  130  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0531  DNA polymerase III, alpha subunit  22.53 
 
 		 1205 aa  130  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  22.23 
 
 		 1155 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.13 
 
 		 769 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  37.57 
 
 		 630 aa  130  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  37.57 
 
 		 630 aa  130  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.7 
 
 		 731 aa  129  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  21.83 
 
 		 1214 aa  130  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  39.34 
 
 		 729 aa  129  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  36.87 
 
 		 603 aa  129  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  36.68 
 
 		 645 aa  129  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  23.03 
 
 		 1170 aa  128  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  39.51 
 
 		 560 aa  128  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  23.57 
 
 		 1153 aa  128  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  23.17 
 
 		 1170 aa  128  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  22.64 
 
 		 1151 aa  127  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  22.5 
 
 		 1159 aa  127  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>