More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1607 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1607  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 		 266 aa  546  1e-154  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0726  DNA polymerase III subunit epsilon  43.51 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1341  DNA polymerase III subunit epsilon  46.3 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0768  DNA polymerase III subunit epsilon  46.08 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0863  DNA polymerase III subunit epsilon  44.19 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1027  DNA polymerase III subunit epsilon  43.32 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.512461  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.17 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0477  DNA polymerase III subunit epsilon  39.91 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.387234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0502  DNA polymerase III subunit epsilon  40.09 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.78 
 
 		 565 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.92 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  34.03 
 
 		 578 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  32.66 
 
 		 584 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1004  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.64 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  33.14 
 
 		 1438 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  33.14 
 
 		 1438 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  33.14 
 
 		 1436 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  33.17 
 
 		 570 aa  99  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  32.14 
 
 		 1397 aa  99  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  30.56 
 
 		 1435 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.94 
 
 		 610 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.85 
 
 		 595 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  33.7 
 
 		 1433 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  31.84 
 
 		 617 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  33.7 
 
 		 1433 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  33.15 
 
 		 970 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  33.15 
 
 		 1433 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  33.15 
 
 		 1433 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  30 
 
 		 1440 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  30.88 
 
 		 645 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.15 
 
 		 196 aa  92.8  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  32.93 
 
 		 720 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  33.9 
 
 		 1433 aa  92.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  30.41 
 
 		 601 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.53 
 
 		 609 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  33.33 
 
 		 616 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.73 
 
 		 715 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  33.52 
 
 		 1433 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  31.16 
 
 		 574 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  31.22 
 
 		 578 aa  89  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  35.68 
 
 		 1465 aa  89  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  31.05 
 
 		 601 aa  89  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.05 
 
 		 584 aa  89  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  32.35 
 
 		 590 aa  89  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  31.05 
 
 		 630 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  30.54 
 
 		 584 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  30.85 
 
 		 574 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  30.5 
 
 		 603 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0978  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.16 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0235504  normal  0.0652516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  29.49 
 
 		 1444 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 769 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  31.18 
 
 		 551 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.91 
 
 		 463 aa  86.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  30.19 
 
 		 1367 aa  86.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  30.19 
 
 		 1367 aa  85.9  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  30.53 
 
 		 630 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  30.53 
 
 		 630 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.43 
 
 		 631 aa  85.9  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.87 
 
 		 180 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.74 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  33.33 
 
 		 1402 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.15 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  28.87 
 
 		 613 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.63 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  30.77 
 
 		 1426 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.81 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  33.77 
 
 		 560 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  29.73 
 
 		 1390 aa  84  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  32.35 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  32.35 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.55 
 
 		 482 aa  82.8  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.82 
 
 		 449 aa  82  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.09 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.89 
 
 		 952 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  31.55 
 
 		 1407 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  34.36 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  32.52 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  30.85 
 
 		 707 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  32 
 
 		 1449 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  29.29 
 
 		 566 aa  80.1  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  29.85 
 
 		 729 aa  79.7  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.87 
 
 		 944 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.93 
 
 		 921 aa  79  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.46 
 
 		 459 aa  79  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  31.43 
 
 		 1449 aa  79  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.82 
 
 		 595 aa  79  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.91 
 
 		 934 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.91 
 
 		 934 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  27.51 
 
 		 1447 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  34.48 
 
 		 934 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  34.48 
 
 		 934 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.43 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.91 
 
 		 934 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>